Resumen

Las infecciones gastrointestinales causadas por Salmonella no tifoidea (SNT) siguen siendo una de las principales causas de enfermedades de transmisión alimentaria en todo el mundo. Dentro de los múltiples serovares de Salmonella enterica existentes, el serovar Rissen es raramente notificado, en particular como causa de salmonelosis humana. Entre 2015 y 2017, el Laboratorio Nacional de Referencia de Infecciones Gastrointestinales de Portugal observó un aumento en el número de casos clínicos causados por S. enterica serovar Rissen multirresistente (MDR), particularmente del archipiélago de las Azores. En el presente estudio, analizamos mediante secuenciación del genoma completo (WGS) todos los aislados clínicos, animales, alimentarios y ambientales recibidos hasta 2017 en los Laboratorios de Referencia portugueses. Como tal, a través de un análisis gen por gen basado en wgMLST, nos propusimos identificar posibles grupos epidemiológicos que vinculan muestras clínicas y de múltiples fuentes, al tiempo que obtuvimos información sobre la diversidad genética de S. enterica serovar Rissen. También investigamos la base genética de la multirresistencia observada. Al integrar 60 nuevos genomas con todos los genomas del serovar Rissen disponibles públicamente, observamos un bajo grado de diversidad genética dentro de este serovar. No obstante, la mayoría de los aislados portugueses mostraban un alto grado de parentesco genético y una posible relación con la producción porcina. Un análisis en profundidad de estos aislados reveló la existencia de dos grandes clusters del archipiélago de las Azores compuestos por aislados MDR, la mayoría de los cuales eran resistentes al menos a cinco antimicrobianos. Teniendo en cuenta la conocida propagación de MDR entre bacterias gastrointestinales, la identificación de clones MDR circulantes debería constituir una alerta para las autoridades de salud pública. Por último, este estudio constituye el punto de partida para la aplicación del enfoque "Una sola salud" para la vigilancia de Salmonella en Portugal.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:S. enterica serovar Rissen, MDR, archipiélago de las Azores, diversidad genética, Laboratorio Nacional de Referencia portugués, genomas disponibles del serovar Rissen, Laboratorios de Referencia portugueses, serovares de Salmonella enterica, multirresistencia observada, posibles conglomerados epidemiológicos.
• Keywords:S. enterica serovar Rissen, MDR, Azores archipelago, genetic diversity, Portuguese National Reference Laboratory, available serovar Rissen genomes, Portuguese Reference Laboratories, Salmonella enterica serovars, observed multidrug resistance, potential epidemiological clusters