Resumen

Muchas envolturas de células arqueas contienen una capa o vaina proteica compuesta por una o más proteínas expuestas a la superficie. Estas proteínas de la capa superficial (capa S) contribuyen a la integridad estructural y protegen la membrana lipídica de los desafíos ambientales. Para explorar la diversidad de especies de estas capas en las Methanosarcinaceae, se identificó mediante proteómica la principal proteína de la capa S en la cepa Fusaro de Methanosarcina barkeri. El producto del gen Mbar_A1758 estaba presente en múltiples formas con tamaños aparentes de 130, 120 y 100 kDa, consistentes con modificaciones postraduccionales que incluyen la escisión del péptido señal y la glicosilación de la proteína. En el genoma de M. barkeri se identificó una proteína con características relacionadas con las proteínas de la capa superficial encontradas en Methanosarcina acetivorans C2A y Methanosarcina mazei Goel. Estos datos revelan una firma proteica conservada distinta con características y arquitectura de la superficie celular implícita en las Methanosarcinaceae que está ausente en otras arqueas. Los patrones de expresión de los genes paralogos en dos especies de Methanosarcina revelaron una expresión abundante de un único paralogo de la capa S en cada cepa. Se identificaron los elementos promotores respectivos y se demostró que se conservan en la codificación del ARNm y en las regiones no traducidas aguas arriba. Anotaciones anteriores del genoma de M. acetivorans asignaron funciones asociadas a la capa S o a la capa superficial de ochenta genes: sin embargo, de los 68 examinados ninguno se expresó significativamente en relación con el gen de la capa S determinado experimentalmente.

• Materias:Bioquímica Ácido ribonucleico (ARN) Arqueas Biogénesis
• Subjects:Biochemistry Ribonucleic acid (RNA) Archeas Biogenesis
• Palabras claves:capa superficial, cepa barkeri fusaro, región no traducida aguas arriba, arquitectura de la superficie celular, elementos promotores respectivos, envoltura celular arquea, patrón de expresión génica, methanosarcina acetivorans c2a, capa, cepa methanosarcina barkeri
• Keywords:surface layer, barkeri strain fusaro, upstream untranslated region, cell surface architecture, respective promoter elements, archaeal cell envelope, gene expression pattern, methanosarcina acetivorans c2a, layer, methanosarcina barkeri strain