Resumen

El estudio de los microRNAs (miRNAs) en plantas ha ganado una atención significativa en los últimos años debido a su papel regulador durante el desarrollo y en respuesta a estreses bióticos y abióticos. Aunque la yuca (Manihot esculenta Crantz) es tolerante a la sequía y a otras condiciones adversas, la mayoría de los miRNAs de yuca se han predicho utilizando únicamente bioinformática o mediante secuenciación de plantas sometidas a estrés biótico. Aquí, utilizamos secuenciación de alto rendimiento y diferentes métodos bioinformáticos para identificar potenciales miRNAs de yuca expresados en diferentes tejidos sometidos a condiciones de calor y sequía. Identificamos 60 miRNAs conservados en otras especies vegetales y 821 potenciales miRNAs específicos de la yuca. También predijimos 134 y 1002 genes diana potenciales para estos dos conjuntos de secuencias. Mediante PCR en tiempo real, verificamos la expresión específica de 5 pequeños ARN de yuca en relación con un control sin estrés. También encontramos, utilizando datos de expresión disponibles públicamente, una expresión significativamente menor de los genes diana predichos de miARNs conservados y no conservados bajo estrés por sequía en comparación con otros genes de yuca. El análisis de enriquecimiento de la ontología génica, junto con la expresión específica de las dianas de miARN predichas, nos permitió identificar varios miARN interesantes que pueden desempeñar un papel en la regulación postranscripcional inducida por el estrés en la yuca y otras plantas.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Genómica Polimorfismo genético Proteómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Genomics Genetic polymorphism Proteomics Computational biology
• Palabras claves:yuca, miARNs, expresión específica, análisis de enriquecimiento de Gene Ontology, Manihot esculenta Crantz, datos de expresión disponibles, diferentes métodos bioinformáticos, la mayoría de miARNs de yuca, otras condiciones adversas, otros genes de yuca.
• Keywords:cassava, miRNAs, specific expression, Gene Ontology enrichment analysis, Manihot esculenta Crantz, available expression data, different bioinformatics methods, most cassava miRNAs, other adverse conditions, other cassava genes