Resumen

Las proteínas superóxido dismutasa (SOD) están ampliamente presentes en el reino vegetal y desempeñan papeles importantes en diferentes procesos biológicos. Sin embargo, se sabe poco sobre los genes SOD en pepino. En este estudio, se identificaron genes SOD nocturnos de pepino (Cucumis sativus) utilizando métodos bioinformáticos, incluyendo 5 Cu/ZnSODs, 3 FeSODs, y 1 MnSOD. La estructura génica y el análisis de motivos indicaron que la mayoría de los genes SOD tienen una disposición exón/intrón y una composición de motivos relativamente conservadas. Los análisis filogenéticos con SODs de pepino y otras especies revelaron que estas proteínas SOD se remontan a dos SODs ancestrales anteriores a la divergencia de las plantas monocotiledóneas y dicotiledóneas. En la secuencia promotora de cada gen CsSOD se encontraron muchos elementos cis relacionados con respuestas al estrés y hormonas vegetales. El análisis de expresión génica reveló que la mayoría de los genes CsSOD se expresan en casi todos los tejidos analizados. El análisis qRT-PCR de 8 genes CsSOD seleccionados mostró que estos genes podían responder al estrés por calor, frío, osmótico y salino. Nuestros resultados proporcionan una base para futuras investigaciones funcionales sobre la familia de genes SOD en pepino y facilitan sus aplicaciones potenciales en la mejora genética del pepino.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:pepino, genes CsSOD, genes SOD, análisis de expresión génica, familia de genes SOD, diferentes procesos biológicos, investigación funcional adicional, genes SOD nocturnos, otras especies diversas, gen CsSOD
• Keywords:cucumber, CsSOD genes, SOD genes, Gene expression analysis, SOD gene family, different biological processes, further functional research, night SOD genes, several other species, CsSOD gene