Resumen

Objetivo. En este trabajo, nos propusimos desarrollar y validar un método de predicción de riesgo mediante genes independientes de pronóstico seleccionados de forma robusta en cáncer de próstata. Método. Se consideraron 723 muestras obtenidas de TCGA (the Cancer Genome Atlas), GSE46602, y GSE21032. Los genes relacionados con el pronóstico del cáncer de próstata con P<0,05 se seleccionaron mediante análisis de regresión de Cox univariable. A continuación, se construyó el modelo genético óptimo de menor AIC (puntuación del criterio de información de Akaike) utilizando el paquete "Rbsurv" en el conjunto de entrenamiento TCGA. Los coeficientes se obtuvieron mediante el análisis de regresión de Cox multivariable. Denominamos CMU5 al nuevo método de pronóstico. La puntuación de riesgo CMU5 se verificó en el conjunto de prueba TCGA, GSE46602 y GSE21032. Resultados. FAM72D, ARHGAP33, TACR2, PLEK2, y FA2H fueron identificados como factores independientes de pronóstico en pacientes con cáncer de próstata. Construimos el modelo de cálculo de la siguiente manera Puntuación de riesgo CMU5 = 1,158∗FAM72D 1,737∗ARHGAP33 - 0,737∗TACR2 - 0,651∗PLEK2 - 0,793∗FA2H. El AUC de DFS fue de 0,809 en el conjunto de entrenamiento (274 muestras), 0,710 en el conjunto de prueba (273 muestras) y 0,768 en el conjunto completo (547 muestras). La capacidad de predicción benigna de CMU5 fue verificada por GSE46602 (36 muestras; AUC=0,6039) y GSE21032 GPL5188 (140 muestras; AUC=0,7083). Utilizando el punto de corte de 2,056, se mostró una diferencia significativa entre los grupos de alto y bajo riesgo. Conclusiones. Se construyó y verificó una fórmula de puntuación de riesgo relacionada con el pronóstico denominada CMU5, que proporciona una predicción fiable del resultado del cáncer de próstata. Esta firma podría proporcionar una base para el tratamiento individualizado del cáncer de próstata.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genómica Inestabilidad genómica Polimorfismo genético
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Genomics Genomic instability Genetic polymorphism
• Palabras claves:muestras, cáncer de próstata, puntuación del criterio de información de Akaike, análisis multivariable de regresión de Cox, análisis univariable de regresión de Cox, nuevo método de pronóstico CMU5, puntuación de riesgo CMU5, Atlas del Genoma del Cáncer, pronóstico del cáncer de próstata, capacidad de predicción benigna
• Keywords:samples, prostate cancer, Akaike information criterion score, Multivariable Cox regression analysis, Univariable Cox regression analysis, new prognosis method CMU5, CMU5 risk score, Cancer Genome Atlas, Prostate cancer prognosis, benign prediction capacity