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Identification of Alternative Variants and Insertion of the Novel Polymorphic AluYl17 in TSEN54 Gene during Primate EvolutionIdentificación de variantes alternativas e inserción del nuevo polimórfico AluYl17 en el gen TSEN54 durante la evolución de los primates

Resumen

TSEN54 codifica una subunidad del complejo endonucleasa de empalme de ARNt, que cataliza la identificación y escisión de intrones a partir de ARNt precursores. Anteriormente, identificamos una transcripción alternativa derivada de AluSx en TSEN54 del mono cynomolgus. La amplificación por transcripción inversa-reacción en cadena de la polimerasa (RT-PCR) y el análisis de la secuencia TSEN54 de muestras de primates y humanos identificaron cinco nuevos transcritos alternativos, incluido el transcrito exonizado por AluSx. Además, realizamos un análisis comparativo de expresión mediante RT-qPCR en varios tejidos de cynomolgus, mono rhesus y humanos. La amplificación RT-qPCR reveló patrones de expresión diferenciales. Además, la amplificación genómica por PCR y la secuenciación de muestras de ADN humano y de primates revelaron que los elementos AluSx estaban integrados en muestras humanas y de todos los primates analizados. Curiosamente, en el ADN genómico del langur, se insertó un elemento AluY adicional en AluSx del intrón ocho de TSEN54. El nuevo elemento AluY mostró una inserción polimórfica. Usando la nomenclatura estandarizada para las repeticiones Alu, el AluY polimórfico del TSEN54 del langur fue designado como perteneciente a la subfamilia AluYl17. Nuestros resultados sugieren que la integración del elemento AluSx en TSEN54 contribuyó a la diversidad en los transcritos e indujo eventos evolutivos específicos de linaje o especie como el splicing alternativo y la inserción polimórfica durante la evolución de los primates.

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Información del documento

  • Titulo:Identification of Alternative Variants and Insertion of the Novel Polymorphic AluYl17 in TSEN54 Gene during Primate Evolution
  • Autor:Ja-Rang, Lee; Young-Hyun, Kim; Sang-Je, Park; Se-Hee, Choe; Hyeon-Mu, Cho; Sang-Rae, Lee; Sun-Uk, Kim; Ji-Su, Kim; Bo-Woong, Sim; Bong-Seok, Song; Kang-Jin, Jeong; Youngjeon, Lee; Yeung Bae, Jin; Philyong, Kang; Jae-Won, Huh; Kyu-Tae, Chang
  • Tipo:Art韈ulo
  • Año:2016
  • Idioma:Ingl閟
  • Editor:Hindawi Publishing Corporation
  • Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
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