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Artículo

Identification of ZEB2 as an Immune-Associated Gene in Endometrial Carcinoma and Associated with Macrophage Infiltration by Bioinformatic AnalysisIdentificación de ZEB2 como un gen inmuno-asociado en el carcinoma de endometrio y asociado con la infiltración de macrófagos mediante análisis bioinformático.

Resumen

El cáncer de endometrio (CE) es el tumor ginecológico más frecuente que surge del endometrio. En este estudio, utilizamos un perfil transcriptómico unicelular publicado del carcinoma endometrial (CE) para revelar la composición de las células inmunitarias y hallamos un entorno inmunosupresor desde la presencia del subtipo M2 de macrófagos y marcadores de células T CD8 agotados. Nos centramos en ZEB2 (Zinc finger E-box binding homeobox 2), un conocido actor en el proceso de transición epitelial a mesenquimal, y demostramos que ZEB2 se expresa exclusivamente en las células inmunes en el transcriptoma unicelular y, al mismo tiempo, se regula a la baja en los datos de RNA-seq de TCGA-UCEC (The Cancer Genome Atlas-Uterine Corpus Endometrial Carcinoma) y se asocia negativamente con la pureza del tumor. La pérdida de proteína ZEB2 en CE en muestras de endometrio normal y CE se validó en muestras mediante inmunohistoquímica (IHC) de la base de datos HPA (Human Protein Atlas). Además, descubrimos que ZEB2 se asociaba con infiltraciones inmunitarias, especialmente de macrófagos, utilizando TIMER 2.0. Curiosamente, la importancia pronóstica de ZEB2 difería según el contenido de macrófagos y células ayudantes Th2 mediante el análisis Kaplan-Meier Plotter. Lo que es más importante, demostramos que más de 11C pacientes tienen mutaciones somáticas de ZEB2 en muestras de CE recogidas de cBioportal y tienen un peso corporal inferior, una edad de diagnóstico más temprana y un mejor estado de supervivencia global y supervivencia libre de enfermedad en comparación con el grupo sin mutaciones. El análisis en TIMER2.0 sugirió que la mutación de ZEB2 posiblemente cambiaría la composición de los linfocitos que infiltran el tumor. En conjunto, mediante la combinación de los resultados de los datos de una sola célula, TCGA RNA-seq, y otras herramientas bioinformáticas en línea, hemos proporcionado pruebas de que ZEB2 podría tener un papel único en el entorno inmunológico de la CE. Estos resultados proporcionarían una mejor comprensión del proceso patogénico y ZEB2 podría utilizarse como diana inmunoterapéutica de la EC.

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