Los Streptomyces se utilizan ampliamente para la producción de metabolitos secundarios con diversas actividades biológicas, incluidos los antibióticos. La necesidad de agentes antimicrobianos alternativos contra patógenos multirresistentes es indispensable. Sin embargo, la producción de nuevos terapéuticos se está retrasando en los últimos tiempos. Por ello, el aislamiento de nuevas especies de Streptomyces ha llamado la atención. Nepal -un país rico en biodiversidad- tiene grandes posibilidades de descubrir miembros de actinomicetos, sobre todo en las zonas de mayor altitud. Sin embargo, en vano, hasta la fecha sólo se ha informado de unos pocos trabajos de investigación de cribado en Nepal. Las especies de Streptomyces se aislaron en el medio ISP4, y la caracterización se realizó de acuerdo con la similitud morfológica y la similitud de la secuencia 16S rRNA utilizando herramientas bioinformáticas. Se prepararon extractos de acetato de etilo de las especies de Streptomyces y la actividad antimicrobiana se llevó a cabo mediante la técnica de difusión en pocillos de agar. En este informe, se han descrito 18 especies de Streptomyces aisladas del suelo a partir del análisis de la secuencia del ARNr 16S. Entre ellas, 12 aislados han mostrado actividad antibacteriana frente a Escherichia coli productora de betalactamasas de espectro extendido (BLEE). Aquí, también hemos analizado el ARNr 16S en 27 especies de Streptomyces cuya secuencia del genoma completo está disponible, lo que ha revelado que algunas especies tienen múltiples copias del gen 16S (∼1,5 kb) con una variación significativa en los nucleótidos. Por el contrario, algunas especies de Streptomyces compartían secuencias de ADN idénticas en múltiples copias del ARNr 16S. La secuenciación de numerosas copias del ARNr 16S no es necesaria, y la secuenciación molecular de esta región no es suficiente para la identificación de especies bacterianas. Los extractos de acetato de etilo derivados de especies de Streptomyces del suelo nepalí demuestran una actividad potencial contra E. coli productora de BLEE. Por lo tanto, son candidatos potenciales para la fabricación de antibióticos en el futuro.
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