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Impact of Sequential Passaging on Protein Expression of E. coli Using Proteomics AnalysisImpacto del paso secuencial en la expresión proteica de E. coli mediante el análisis proteómico

Resumen

La infección del tracto urinario (ITU) es una de las infecciones bacterianas más prevalentes en el mundo y afecta a la vejiga y el riñón. Escherichia coli (E. coli) es el principal agente causal del 80-90% de las ITU adquiridas en la comunidad, de alrededor del 40% de las ITU nosocomiales y del 25% de las ITU recurrentes. El campo de la proteómica ha surgido como una gran herramienta para analizar las proteínas expresadas con el fin de identificar posibles biomarcadores asociados a muchos estados patológicos y, en la misma medida, los asociados a la patogénesis bacteriana y su capacidad para causar infecciones recurrentes. En un estudio piloto descriptivo transversal, empleamos técnicas proteómicas para investigar los efectos del estrés ambiental sobre los perfiles proteicos de E. coli simulados mediante el paso secuencial de muestras de pacientes con infecciones urinarias, con el fin de detectar proteínas únicas que surgen en entornos estresantes y que podrían ayudar a la detección precoz de las infecciones urinarias. Se recogieron cuatro muestras de orina de individuos con ITU recurrente y se subcultivaron secuencialmente; se extrajeron muestras de proteínas de los precipitados bacterianos y se analizaron mediante electroforesis en gel bidimensional (2DGE). Las manchas proteicas de interés derivadas de los cambios en el perfil proteico se analizaron mediante cromatografía líquida-espectrometría de masas (LC-MS/MS) y se cotejaron con bases de datos conocidas para identificar proteínas relacionadas. Se identificaron ATPB_ECOBW, ASPA ECOLI, DPS ECOL6 y DCEB ECOLI como proteínas asociadas a un mayor pasaje. Llegamos a la conclusión de que el pasaje producía cambios identificables en el perfil proteico de E. coli, a saber, proteínas asociadas con la supervivencia y la posible adaptación de las bacterias, lo que sugiere la existencia de factores que contribuyen a la resistencia a los antibióticos y a las ITU recurrentes. Además, nuestro método podría seguir utilizándose para identificar proteínas indicadoras candidatas que podrían formar parte de una base de datos de proteínas cada vez mayor para diagnosticar e identificar agentes causantes de infecciones urinarias.

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