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Influence of Mg2+ ions on the interaction between 3,5-dicaffeoylquinic acid and HTLV-I integraseInfluencia de los iones Mg2 + en la interacción entre el ácido 3,5-dicafeoilquínico y la integrasa HTLV-I

Resumen

Usando simulación molecular, estudiamos la influencia de los iones Mg2 + en la interacción del dominio catalítico de la integrasa HTLV-I (IN) (modelado por homología) con el ácido 3,5-Dicafeoilquínico (DCQA). Materiales y métodos. El modelo por homología de la HTLV-I IN fue construido usando como molde la estructura cristalina de la IN del virus del sarcoma aviar (VSA, pdb: 1VSD). Para analizar el rol de los iones Mg2 + en la interacción con el DCQA y la integrasa, tres modelos fueron creados: i) en ausencia de iones Mg2 +, ii) con un ion Mg2 + coordinado con Asp15 y Asp72 y iii) con dos iones Mg2 + coordinados con Asp15-Asp72 y Asp72-Glu108. Las fuerzas de interacción y la energía libre de unión entre el DCQA y la HTLV-I IN fueron calculadas en los tres modelos. Resultados. El puntaje más bajo en el docking y la menor energía libre fueron obtenidos para el modelo con un solo ion de Mg2 +. El Mg2 + afecta fuertemente el acoplamiento del inhibidor DCQA con el dominio catalítico de la HTLV-I IN, revelando una fuerte interacción entre el complejo ligando-proteína que es independiente del sitio catalítico de los tres modelos usados. Conclusión. Los resultados sugieren que la presencia de un ion de Mg2 + podría incrementar la interacción en el complejo debido a la disminución de la energía libre, intensificando así la afinidad. Por lo que, proponemos al DCQA como farmacóforo para el diseño de drogas antiretrovirales

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Información del documento

  • Titulo:Influence of Mg2+ ions on the interaction between 3,5-dicaffeoylquinic acid and HTLV-I integrase
  • Autor:Acevedo, Orlando; Cuesta Astroz, Yesid; García Vallejo, Felipe; Lareo, Leonardo; Peña, Ángela; Yosa, Juvenal
  • Tipo:Artículo
  • Año:2012
  • Idioma:Inglés
  • Editor:Pontificia Universidad Javeriana
  • Materias:Ácidos Catálisis Dinámica molecular Enzimas Magnesio
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