Resumen

La mayoría de los estudios proteómicos sobre muestras de tejidos implican el uso de un enfoque basado en geles para la elaboración de perfiles y la digestión. El laborioso enfoque basado en el gel está siendo sustituido poco a poco por el avance del enfoque de digestión en solución. Sin embargo, siguen existiendo varias dificultades, como las proteínas difíciles de solubilizar, el análisis proteómico deficiente en muestras tisulares complejas y la presencia de impurezas en las muestras. Por lo tanto, hay una gran demanda para formular un tampón de extracción de proteínas altamente eficiente con una alta eficiencia de extracción de proteínas a partir de muestras de tejido, una alta compatibilidad con la digestión en solución, un número reducido de pasos de manipulación de la muestra para reducir la pérdida de la misma, un bajo consumo de tiempo, un bajo coste y una facilidad de uso. Aquí, evaluamos varios tampones de extracción de proteínas existentes con muestras de tumores de hígado de pez cebra y descubrimos que el tampón de extracción basado en desoxicolato de sodio (DOC) con desnaturalización por calor era el enfoque más eficaz para la extracción altamente eficiente de proteínas de tejidos complejos como el tumor de hígado de pez cebra. Se han identificado un total de 4.790 proteínas utilizando el enfoque de la proteómica de escopeta con LC 2D, que hasta donde sabemos es el estudio más completo del proteoma del tumor de hígado del pez cebra.

• Materias:Análisis cromatográfico Química farmacéutica Análisis químico Método espectrofotométrico
• Subjects:Chromatographic analysis Chemistry pharmaceutical Chemical test Spectrophotometric method
• Palabras claves:tumor de hígado de pez cebra, enfoque basado, muestra de tejido, facilidad de uso, análisis proteómico deficiente, extracción de proteínas, bajo consumo de tiempo, eficiencia de extracción de proteínas, presencia de muestra, tampón de extracción de proteínas
• Keywords:zebrafish liver tumor, based approach, tissue sample, ease of usage, poor proteomic analysis, extraction of protein, low time consumption, protein extraction efficiency, presence of sample, protein extraction buffer