Resumen

Los transcriptomas de mamíferos están formados principalmente por ARN no codificantes de proteínas. Estos ARNnc desempeñan diversas funciones en todas las células y participan en múltiples vías de regulación. Más recientemente, los ARNnc también se han descrito como valiosas herramientas de diagnóstico. Aunque los métodos RNA-seq sustituyen progresivamente a las tecnologías basadas en microarrays para la elaboración de perfiles de expresión de alto rendimiento, todavía no se utilizan de forma rutinaria en el diagnóstico. Los microarrays, por otro lado, se utilizan más ampliamente para la elaboración de perfiles de diagnóstico, especialmente para ncRNA muy pequeños (por ejemplo, miRNAs), empleando arrays de ácido nucleico bloqueado (LNA). Sin embargo, los microarrays de LNA son bastante caros para estudios de alto rendimiento dirigidos a ncRNAs más largos, mientras que los arrays de DNA no proporcionan resultados satisfactorios para el análisis de RNAs pequeños. Aquí describimos una plataforma mixta de microarrays de ADN/ARNL, en la que ncARNs pequeños y largos marcados directamente se hibridan en sondas de ARNL o sondas de ADN personalizadas, respectivamente, lo que permite un análisis sensible y específico de una población compleja de ARN en un único array en un solo experimento. El sistema ADN/ARNL, que requiere cantidades relativamente bajas de ARN total y cumple las referencias de diagnóstico, se aplicó con éxito al análisis de la expresión diferencial de ARNnc en células madre embrionarias de ratón y células cerebrales adultas.

• Materias:Genética molecular Ácido ribonucleico (ARN) Genómica Reacción en cadena de la polimerasa (PCR) Ácidos nucleicos
• Subjects:Molecular genetics Ribonucleic acid (RNA) Genomics Polymerase chain reaction Nucleic acids
• Palabras claves:ncrnas más largos, plataforma de microarrays de lna, células cerebrales adultas, población compleja de rna, sondas de adn personalizadas, expresión diferencial de ncrna, células madre embrionarias, múltiples vías de regulación, perfiles de expresión de alto rendimiento, valiosas herramientas de diagnóstico
• Keywords:longer ncrnas, lna microarray platform, adult brain cells, complex rna population, custom dna probes, differential ncrna expression, embryonic stem cells, multiple regulation pathways, throughput expression profiling, valuable diagnostic tools