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Gene Expression Profiling in Human High-Grade AstrocytomasPerfiles de expresión génica en astrocitomas humanos de alto grado

Resumen

El astrocitoma difuso de (grado II de la OMS) tiene tendencia a progresar espontáneamente a astrocitoma anaplásico (grado III de la OMS) y/o glioblastoma (grado IV de la OMS). Sin embargo, aún no se conocen bien las bases moleculares de la progresión del astrocitoma. En el presente estudio, un paso inicial esencial hacia este objetivo es el establecimiento de la taxonomía de los tumores sobre la base de sus perfiles de expresión génica. Hemos utilizado perfiles de expresión génica, métodos de aprendizaje no supervisado (cluster jerárquico [HCL] y análisis de componentes principales [PCA]) y supervisado (análisis de predicción para microarrays [PAM]), para demostrar la presencia de tres firmas de expresión génica distintas de astrocitomas (ACM), que corresponden a astrocitoma difuso o de bajo grado (grado II de la OMS), astrocitoma anaplásico (grado III de la OMS) y glioblastoma multiforme (grado IV de la OMS). También demostramos un clasificador basado en 171 genes que caracteriza la distinción entre estos subconjuntos patológicos/moleculares de astrocitomas. Estos resultados definen aún más los subtipos moleculares de astrocitomas y pueden utilizarse potencialmente para definir objetivos potenciales y refinar aún más los enfoques de estratificación para la terapia. Además, este estudio demuestra que la combinación de análisis de expresión génica con recursos detallados de vías anotadas y categorías de ontología génica (GO) se aplicó a una población normal y tumoral altamente enriquecida; puede producir una comprensión del mecanismo biológico crítico de los astrocitomas.

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