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ProtDataTherm: A database for thermostability analysis and engineering of proteinsProtDataTherm: una base de datos para análisis de termoestabilidad e ingeniería de proteínas

Resumen

El diseño de proteínas termoestables es una herramienta poderosa que permite mejorar la resistencia de las proteínas frente a altas temperaturas, ampliando el campo de aplicación. Para el diseño eficiente de estas proteínas es necesario disponer de diferentes fuentes de datos clasificados por termoestabilidad, incluidas secuencias y estructuras 3D para diferentes familias de proteínas. Sin embargo, no hay ninguna fuente de datos disponible que proporcione dichos datos fácilmente. Este trabajo propone una base de datos integral que contiene secuencias de proteínas que pertenecen a diferentes microorganismos y se agrupan en función de la identificación de Pfam. El usuario puede encontrar el ID Pfam de una proteína de interés y encontrar sus homólogos, categorizados como psicrófila, mesófila y termófila. Además de las secuencias, también se proporcionan los ID de PDB si hay una estructura 3D disponible para el ID de Pfam de interés.

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  • Idioma:Inglés
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Información del documento

  • Titulo:ProtDataTherm: A database for thermostability analysis and engineering of proteins
  • Autor:Modarres, Hassan Pezeshgi; Mofrad, Mohammad R.; Sanati-Nezhad, Amir
  • Tipo:Artículo
  • Año:2019
  • Idioma:Inglés
  • Editor:Plos
  • Materias:Ingeniería biomédica Bioingeniería Ingeniería genética
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