Resumen

Aunque muchos estudios han examinado los mecanismos por los que los Deinococci extremófilos sobreviven a la exposición a la radiación ionizante, muy pocas publicaciones han caracterizado las adaptaciones al choque frío de este grupo, a pesar de que muchas especies se encuentran en entornos fríos persistentes y propensos a importantes fluctuaciones diarias de temperatura. Las proteínas bacterianas de choque frío (Csps) son una familia de proteínas chaperonas de ARN conservadas que suelen desempeñar un papel en la adaptación a temperaturas frías, incluido un cambio descendente de la temperatura (es decir, choque frío). El objetivo principal de este estudio era comprobar si un Deinococcus representativo del desierto, Deinococcus maricopensis, codifica Csps como parte de su genoma. Se utilizaron métodos bioinformáticos para identificar una Csp de D. maricopensis LB-34. La Csp, denominada DB-34, codifica una Csp de D. maricopensis. La Csp, denominada Dm-Csp1, contiene características de secuencia de las Csps, incluido un dominio conservado de choque frío y motivos de unión a ácidos nucleicos. Un modelo terciario de Dm-Csp1 reveló una estructura anticipada de Csp que contiene cinco hebras beta antiparalelas, y los experimentos de predicción de ligandos identificaron residuos situados N-terminalmente capaces de unir ácidos nucleicos monocatenarios. Se identificaron Csps putativas en el 100% (27 de 27) de las especies de Deinococci para las que se dispone de información genómica; y las Csps codificadas por Deinococci identificadas contienen una región localizada C-terminalmente que parece estar limitada a los miembros de la clase Deinococci.

• Materias:Microbiología Bacteriología Biología molecular Propiedades farmacológicas Infectología
• Subjects:Microbiology Bacteriology Molecular biology Pharmacological Properties Infectious disease medicine
• Palabras claves:Csps, proteínas bacterianas de choque frío, dominio conservado de choque frío, fluctuaciones diarias significativas de temperatura, proteínas chaperonas de ARN, adaptaciones al choque frío, adaptación a temperaturas frías, experimentos de predicción de ligandos, entornos fríos persistentes, Csp
• Keywords:Csps, Bacterial cold shock proteins, conserved cold shock domain, significant daily temperature fluctuations, RNA chaperone proteins, cold shock adaptations, cold temperature adaptation, ligand prediction experiments, persistent cold environments, Csp