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Complete Genome Sequence of Photobacterium damselae Subsp. damselae Strain SSPD1601 Isolated from Deep-Sea Cage-Cultured Sebastes schlegelii with Septic Skin UlcerSecuencia completa del genoma de la cepa SSPD1601 de Photobacterium damselae Subsp. damselae aislada de Sebastes schlegelii cultivado en jaulas en aguas profundas con úlcera cutánea séptica

Resumen

Photobacterium damselae subsp. damselae (PDD) es una bacteria Gram negativa que puede infectar a diversos organismos acuáticos y a seres humanos. Según una investigación epidemiológica realizada en los últimos tres años, la PDD es uno de los patógenos más importantes causantes de úlceras cutáneas sépticas en Sebastes schlegelii cultivado en jaulas en aguas profundas de la zona del mar de Huang-Bohai y está presente durante todo el año con gran abundancia. Para comprender mejor la patogenicidad de esta especie, se analizaron las propiedades patogénicas y el genoma de la cepa PDD SSPD1601. Los resultados revelaron que la cepa PDD SSPD1601 es una célula en forma de bastón con un único flagelo polar, y que los síntomas clínicos se reproducían durante la infección artificial. El genoma de SSPD1601 consta de dos cromosomas y dos plásmidos, con un total de 4.252.294 pb y 3.751 secuencias codificantes (CDS), 196 genes tRNA y 47 genes rRNA. En la cepa SSPD1601 se encontraron factores de virulencia comunes como flagelina, Fur, RstB, hcpA, OMPs, htpB-Hsp60, VasK y vgrG. Además, SSPD1601 es una cepa pPHDD1-negativa que contiene el gen de la hemolisina hlyAch y tres hemolisinas putativas (emrA, yoaF, y VPA0226), que son probablemente responsables de la patogenicidad de SSPD1601. El análisis filogenético reveló que SSPD1601 está más estrechamente relacionada con Phdp Wu-1. Además, el fenotipo de resistencia a los antibióticos indicó que SSPD1601 no era sensible a la ceftazidima, pipemídico, estreptomicina, cefalexina, bacitracina, cefoperazona sódica, acetilspiramicina, claritromicina, amikacina, gentamicina, kanamicina, oxacilina, ampicilina y trimetoprim-sulfametoxazol, pero sólo se detectó el gen de resistencia a la bacitracina bacA según la base de datos de genes de resistencia a los antibióticos. Estos resultados amplían nuestra comprensión de la PDD y sientan las bases para nuevos estudios sobre su patogénesis y la prevención de la enfermedad.

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Información del documento

  • Titulo:Complete Genome Sequence of Photobacterium damselae Subsp. damselae Strain SSPD1601 Isolated from Deep-Sea Cage-Cultured Sebastes schlegelii with Septic Skin Ulcer
  • Autor:Yongxiang, Yu; Zheng, Zhang; Yingeng, Wang; Meijie, Liao; Xiaojun, Rong; Bin, Li; Kai, Wang; Jing, Chen; Hao, Zhang
  • Tipo:Artículo
  • Año:2019
  • Idioma:Inglés
  • Editor:Hindawi
  • Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
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