Las aguas residuales municipales provocan contaminación en las aguas de los ríos, la cual se refleja a menudo en parámetros bacteriológicos tales como coliformes totales, coliformes fecales y estreptococos fecales del agua. Los principales ríos de la India han mostrado la presencia de grandes cantidades de estos microorganismos. Este tipo de contaminación es agudo en el estado de Assam, debido principalmente a la descarga de aguas residuales municipales sin tratamiento en los sistemas fluviales cercanos.
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