La técnica de desplazamiento de la cadena de ADN se utiliza ampliamente en la programación del ADN, los biosensores de ADN y el análisis de genes. En el desplazamiento de la cadena de ADN, las reacciones con fugas pueden hacer que las señales de ADN decaigan y que falle la detección de las señales de ADN. El método más utilizado para evitar fugas es la limpieza después de las reacciones de fuga aguas arriba, y sigue siendo un reto desarrollar una técnica fiable de desplazamiento de la cadena de ADN con bajas fugas. En este trabajo, abordamos el reto mediante la evaluación experimental de los factores básicos, incluyendo el tiempo de reacción, la proporción de reactivos, y la concentración de iones a la fuga en el desplazamiento de la cadena de ADN. Específicamente, se diseñan sondas fluorescentes y una estructura de horquilla que informa de la cadena de ADN para detectar la salida del desplazamiento de la cadena de ADN, y así poder evaluar la fuga de las reacciones de desplazamiento de la cadena de ADN con diferentes tiempos de reacción, proporciones de reactivos y concentraciones de iones. A partir de los datos obtenidos, se logran modelos matemáticos para evaluar la fuga mediante la derivación de curvas. Como resultado, se obtiene que un tiempo de incubación largo, una alta concentración de hebra combustible y una cantidad inadecuada de concentración de iones pueden debilitar las reacciones de fuga. Esto contribuye a un método para establecer las condiciones de reacción adecuadas para reducir las fugas en el desplazamiento de la cadena de ADN.
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