Resumen

Los recién nacidos son colonizados rápidamente por microbios y sus tractos intestinales contienen comunidades microbianas altamente dinámicas y de rápido desarrollo en los primeros meses de vida. En este estudio, describimos la viabilidad de aislar ARNm a partir de muestras fecales procesadas rápidamente y aplicar un análisis profundo de ARN-Seq para proporcionar información sobre los contribuyentes activos de la comunidad microbiana en los primeros meses de vida. Se presta especial atención al impacto de la eliminación del ARNr del ARNm en el perfil filogenético y transcripcional y en la profundidad del análisis. Se realizó un seguimiento de un bebé amamantado durante los seis primeros meses de vida, durante su adaptación a los alimentos sólidos, los productos lácteos y la leche de fórmula. Se observó que, en el periodo de destete, la actividad transcripcional total de Actinobacteria, representada principalmente por Bifidobacterium, disminuía, mientras que la de Firmicutes aumentaba con el tiempo. Además, se observó que las Firmicutes y las Actinobacterias, incluidas las Bifidobacterias canónicas y la Collinsella, contribuían de forma importante a la fermentación de carbohidratos y a la biosíntesis de vitaminas en el intestino del lactante. Por último, se detectó la expresión de genes similares a los de Lactobacillus rhamnosus, probablemente tras la transferencia de la madre que consumió L. rhamnosus GG. El estudio indica que el análisis metatranscriptómico de la microbiota intestinal infantil es factible en muestras de heces de lactantes y puede utilizarse para conocer las actividades básicas de la comunidad en desarrollo.

• Materias:Microbiología Bacteriología Biología molecular Propiedades farmacológicas Infectología
• Subjects:Microbiology Bacteriology Molecular biology Pharmacological Properties Infectious disease medicine
• Palabras claves:L. rhamnosus GG, microbiota intestinal infantil, muestras de heces infantiles, actividad transcripcional total, Actinobacteria, Firmicutes, perspicacia, vida, ARNm, estudio
• Keywords:L. rhamnosus GG, infant gut microbiota, infant stool samples, total transcriptional activity, Actinobacteria, Firmicutes, insight, life, mRNA, study