La estructura de una molécula está relacionada con diversos componentes, entre los cuales se pueden mencionar: tipos de elementos de la tabla periódica (metales, no metales, metaloides y gases nobles), así como la cantidad de estos elementos (subíndice) y coeficientes estequiométricos, tipo de enlace (iónico, covalente y metálico), así como la distribución en el espacio de los núcleos de los átomos.