El aguacate (Persea americana) y la papaya (Carica papaya) son frutas tropicales con gran demanda internacional. Sin embargo, estos cultivos de importancia comercial se ven afectados por el hongo Colletotrichum gloeosporioides, causante de la antracnosis y que provoca importantes pérdidas económicas. Se evaluó la actividad antifúngica de nanomateriales de óxido metálico (óxido de zinc (ZnO), óxido de magnesio (MgO) y compuestos de ZnO:MgO y ZnO:Mg(OH)2) preparados en diferentes condiciones de síntesis frente a cepas de C. gloeosporioides obtenidas de papaya y aguacate. Todas las nanopartículas (NPs) a las concentraciones ensayadas inhibieron significativamente la germinación de conidias y causaron daños estructurales a las células fúngicas. Según la prueba de crecimiento radial, la cepa fúngica obtenida del aguacate fue más susceptible a las NPs que la cepa obtenida de la papaya. El efecto de las NPs ensayadas sobre las cepas fúngicas confirmó que estas NPs podrían utilizarse como potentes agentes antifúngicos contra C. gloeosporioides para controlar la antracnosis en frutas tropicales.