Flavobacterium columnare es el agente causal de la enfermedad columnaris en peces de agua dulce, implicado en enfermedades de la piel y las branquias, que a menudo causan una alta mortalidad. El objetivo de este estudio fue el aislamiento y la caracterización de Flavobacterium columnare en peces tropicales de Brasil. Se examinaron piracanjuba (Brycon orbignyanus), pacú (Piaractus mesopotamicus), tambaquí (Colossoma macropomum) y cascudo (Hypostomus plecostomus) en busca de lesiones externas que mostraran signos de enfermedad columnaris, como manchas blancas grisáceas, especialmente en la cabeza, la parte dorsal y la aleta caudal. El muestreo comprendió 50 muestras representativas de cuatro especies de peces diferentes seleccionadas para el estudio. Las muestras para cultivo se obtuvieron mediante raspados de piel y riñón con hisopos de algodón estériles de peces con enfermedad columnaris, y se sembraron en un medio de cultivo artificial Carlson y Pacha (1968) (caldo y sólido), que se utilizó para el aislamiento. Las cepas en el medio líquido eran Gram negativas, largas y filamentosas, presentaban movimientos de flexión (movilidad de deslizamiento), contenían una gran cantidad de bacterias largas y delgadas y se agrupaban en columnas. Las cepas en el agar produjeron colonias de color amarillo pálido, bastante pequeñas, planas y con bordes rizoides. Se aislaron cuatro cepas de Flavobacterium columnare: una de Brycon orbignyanus, otra de Piaractus mesopotamicus, otra de Colossoma macropomum y otra de Hypostomus plecostomus. La caracterización bioquímica, con la absorción del colorante rojo Congo, la producción de pigmentos tipo flexirrubina, la producción de H₂S y la reducción de nitratos, demostró que el aislado podía clasificarse como Flavobacterium columnare.