La aleatorización mendeliana y el metaanálisis de GWAS revelaron el efecto de aumento del riesgo de la esquizofrenia sobre los cánceres
Autores: Yuan, Kai; Song, Weichen; Liu, Zhe; Lin, Guan Ning; Yu, Shunying
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 13
Citaciones: Sin citaciones
La relación causal entre el cáncer y la esquizofrenia (SCZ) sigue siendo controvertida. Algunos investigadores han encontrado que la SCZ es un factor preventivo del cáncer en estudios de cohortes o metaanálisis, mientras que otros han encontrado lo contrario. Para entender mejor este problema, utilizamos la aleatorización mendeliana de dos muestras (2SMR) en los resultados resumidos de GWAS disponibles para evaluar posibles conexiones genéticas entre la SCZ y 13 tipos de cáncer. Descubrimos que la susceptibilidad genética a la esquizofrenia conduce a un aumento del riesgo de cáncer de mama (razón de probabilidades [OR] por aumento en log-odds del riesgo de esquizofrenia: 1.049, intervalo de confianza [CI] del 95%: 1.023-1.075; = 0.00012; FDR = 0.0017), cáncer de ovario (OR, 1.326; CI del 95%, 1.267-1.387; = 0.0007; FDR = 0.0045) y cáncer de tiroides (OR, 1.575; CI del 95%, 1.048-2.365; = 0.0285; FDR = 0.123). En segundo lugar, realizamos un metaanálisis basado en las estadísticas resumidas de GWAS de la SCZ y los tres tipos de cáncer significativos. A continuación, asociamos variantes genéticas a genes utilizando dos estrategias de mapeo genético: (a) mapeo posicional basado en la proximidad genómica y (b) mapeo de loci de rasgos cuantitativos de expresión (eQTL) basado en la vinculación de la expresión génica en múltiples tejidos. Como resultado, identificamos 114 loci compartidos y 437 genes compartidos en tres grupos, respectivamente. El análisis de enriquecimiento funcional muestra que las vías biológicas más enriquecidas están relacionadas con la modificación epigenética. Además, notamos que la SCZ afectaría el nivel de la hormona estimulante de tiroides (OR, 1.095; CI del 95%, 1.006-1.191; = 0.0354; FDR = 0.177), lo que podría afectar aún más el nivel de estrógeno y el riesgo de los tres tipos de cáncer mencionados. En conclusión, nuestros hallazgos bajo la suposición de 2SMR proporcionan información crucial sobre el efecto de aumento del riesgo de la SCZ en el riesgo de tres tipos de cáncer. Además, estos resultados pueden proporcionar información para entender la predisposición genética y las vías biológicas subyacentes de la SCZ comórbida y los cánceres.
Descripción
La relación causal entre el cáncer y la esquizofrenia (SCZ) sigue siendo controvertida. Algunos investigadores han encontrado que la SCZ es un factor preventivo del cáncer en estudios de cohortes o metaanálisis, mientras que otros han encontrado lo contrario. Para entender mejor este problema, utilizamos la aleatorización mendeliana de dos muestras (2SMR) en los resultados resumidos de GWAS disponibles para evaluar posibles conexiones genéticas entre la SCZ y 13 tipos de cáncer. Descubrimos que la susceptibilidad genética a la esquizofrenia conduce a un aumento del riesgo de cáncer de mama (razón de probabilidades [OR] por aumento en log-odds del riesgo de esquizofrenia: 1.049, intervalo de confianza [CI] del 95%: 1.023-1.075; = 0.00012; FDR = 0.0017), cáncer de ovario (OR, 1.326; CI del 95%, 1.267-1.387; = 0.0007; FDR = 0.0045) y cáncer de tiroides (OR, 1.575; CI del 95%, 1.048-2.365; = 0.0285; FDR = 0.123). En segundo lugar, realizamos un metaanálisis basado en las estadísticas resumidas de GWAS de la SCZ y los tres tipos de cáncer significativos. A continuación, asociamos variantes genéticas a genes utilizando dos estrategias de mapeo genético: (a) mapeo posicional basado en la proximidad genómica y (b) mapeo de loci de rasgos cuantitativos de expresión (eQTL) basado en la vinculación de la expresión génica en múltiples tejidos. Como resultado, identificamos 114 loci compartidos y 437 genes compartidos en tres grupos, respectivamente. El análisis de enriquecimiento funcional muestra que las vías biológicas más enriquecidas están relacionadas con la modificación epigenética. Además, notamos que la SCZ afectaría el nivel de la hormona estimulante de tiroides (OR, 1.095; CI del 95%, 1.006-1.191; = 0.0354; FDR = 0.177), lo que podría afectar aún más el nivel de estrógeno y el riesgo de los tres tipos de cáncer mencionados. En conclusión, nuestros hallazgos bajo la suposición de 2SMR proporcionan información crucial sobre el efecto de aumento del riesgo de la SCZ en el riesgo de tres tipos de cáncer. Además, estos resultados pueden proporcionar información para entender la predisposición genética y las vías biológicas subyacentes de la SCZ comórbida y los cánceres.