El arroz de rastrojo es un modelo de cultivo sostenible, y su rendimiento está estrechamente relacionado con la eficiencia en el uso de la luz y la temperatura. El cociente fototérmico (PQ), un parámetro clave para evaluar la eficiencia en el uso de la luz y la temperatura, influye significativamente en el rendimiento del arroz de rastrojo. Sin embargo, la investigación sobre cómo diferentes alturas de rastrojo afectan el PQ y la eficiencia de utilización de los recursos de luz y temperatura sigue siendo limitada. Aquí, realizamos un experimento de campo de dos años para investigar la eficiencia en el uso de la radiación (RUE), la eficiencia en el uso de la temperatura acumulada efectiva (TUE), el PQ, el porcentaje de interceptación (IP), la radiación fotosintéticamente activa interceptada (IPAR) y el peso seco total (TDW) de seis variedades de arroz de rastrojo bajo dos tratamientos de altura de rastrojo (HS: rastrojo alto, LS: rastrojo bajo) durante la temporada de rastrojo. Este estudio tuvo como objetivo analizar cómo diferentes alturas de rastrojo impactan el rendimiento del arroz de rastrojo evaluando la eficiencia en la utilización de los recursos de luz y temperatura e investigar la relación entre el PQ y el rendimiento del arroz de rastrojo. Los resultados mostraron que el tratamiento HS aumentó significativamente el rendimiento de la temporada de rastrojo en comparación con el tratamiento LS, con aumentos de rendimiento promedio del 21.2% y 28.1% en 2022 y 2023, respectivamente. Este aumento en el rendimiento se atribuyó a una mejora en el TDW bajo el tratamiento HS, impulsada por un aumento en el IP, IPAR, RUE y TUE. Notablemente, el PQ fue significativamente más bajo bajo el tratamiento HS que bajo el tratamiento LS. Esta reducción se atribuyó principalmente a la disminución de la duración disponible para la acumulación de luz y calor, lo que redujo el PQ. El análisis de correlación reveló una asociación positiva significativa entre el rendimiento de la temporada principal y el PQ, mientras que el rendimiento de la temporada de rastrojo mostró una correlación negativa con el PQ. En conclusión, el tratamiento HS aumentó el IP y el IPAR, mejoró el TUE y el RUE, y redujo el PQ, contribuyendo colectivamente a mayores rendimientos en la temporada de rastrojo. Es importante destacar que nuestros hallazgos indican que el PQ puede predecir de manera más efectiva los cambios en el rendimiento en la temporada de rastrojo bajo el tratamiento HS, proporcionando una base teórica para optimizar la utilización de los recursos de luz y temperatura en el arroz de rastrojo.