La enfermedad renal crónica (ERC) es un problema de salud común y mundial, y una de las causas más importantes de morbilidad y mortalidad. La mayoría de la investigación primaria sobre esta enfermedad requiere evaluar el índice de fibrosis en riñones de modelos animales, específicamente utilizando la tinción de tricrómico de Masson. Se utilizan diferentes programas para calcular el porcentaje de fibrosis; sin embargo, el análisis consume mucho tiempo ya que se debe realizar una imagen a la vez. CellProfiler(tm) es un programa diseñado para analizar datos obtenidos de muestras biológicas y puede procesar múltiples imágenes a través de tuberías, y los resultados pueden ser exportados a bases de datos. Este artículo explica cómo CellProfiler(tm) puede ser utilizado para analizar automáticamente fotomicrografías de histología renal de muestras teñidas con la tinción de tricrómico de Masson para evaluar el porcentaje de fibrosis en un modelo animal experimental de ERC. Se creó una tubería para analizar diapositivas teñidas con tricrómico de Masson en un modelo de ERC inducida por adenina a dosis de 50 mg/kg y 100 mg/kg, además de muestras con el vehículo (75% de glicerina). Los resultados se compararon con los obtenidos por ImageJ, y no se encontraron diferencias significativas entre ambos programas. La tubería de CellProfiler(tm) creada aquí es una alternativa confiable, rápida y fácil para el análisis y cuantificación de la fibrosis renal en modelos animales experimentales.