Los alimentos contienen diversos compuestos y existen muchos métodos disponibles para analizar cada uno de estos componentes. Sin embargo, las grandes cantidades de metabolitos de bajo peso molecular en los alimentos, como aminoácidos, ácidos orgánicos, vitaminas, lípidos y toxinas, dificultan el análisis de la distribución espacial de estas moléculas. La espectrometría de masas por ionización y desorción con láser asistida por matriz (MALDI-MS) es una tecnología de ionización bidimensional que permite la detección de pequeños metabolitos en secciones de tejido sin necesidad de purificación, extracción, separación o etiquetado. La aplicación de la imagen MALDI-MS en el análisis de alimentos mejora la visualización de estos compuestos para identificar no solo el contenido nutricional, sino también el origen geográfico de los alimentos. En esta revisión, proporcionamos una visión general de algunas aplicaciones recientes de la imagen MALDI-MS, demostrando las ventajas y perspectivas de esta tecnología en comparación con enfoques convencionales. Se espera que el desarrollo y la mejora de la imagen MALDI-MS ofrezcan grandes beneficios a consumidores, investigadores y productores de alimentos en cuanto a la mejora de la cría, la trazabilidad, el desarrollo de alimentos con valor agregado y la mejora de las evaluaciones de seguridad.