Análisis de la Estructura de la Comunidad Microbiana en Cada Etapa de Desarrollo
Autores: Liu, Yonghong; Dong, Xiaonan; Sun, Lianyang; Cui, Hao; Kang, Jiamei; Bu, Nan; Zhang, Yishuai; Qi, Zehao; Li, Zixuan; Zhang, Zilong; Zhao, Li
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Garrapatas
Microorganismos patógenos
Mongolia Interior
Extracción de ácidos nucleicos
Secuenciación Illumina
Estructuras de comunidades microbianas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 7
Citaciones: Sin citaciones
Las garrapatas son el segundo vector de patógenos más significativo en todo el mundo. es una de las especies de garrapatas dominantes en Mongolia Interior que puede llevar y transmitir varios microorganismos patógenos. Sin embargo, solo se ha detectado un patógeno específico en una etapa de desarrollo particular de , además, el análisis metagenómico se ha realizado solo en la etapa de garrapata adulta. En este estudio, utilizamos en diferentes etapas de desarrollo (garrapatas adultas hembras de primera generación, huevos, garrapatas larvales, garrapatas larvales engordadas, garrapatas ninfas, garrapatas ninfas engordadas y garrapatas adultas de segunda generación) de Mongolia Interior como materiales para la extracción de ácidos nucleicos. Posteriormente, construimos bibliotecas Illumina PE250 e Illumina PE150 y las secuenciamos en la plataforma Illumina NovaSeq 6000. Finalmente, utilizamos software de biología molecular y una plataforma de análisis de secuencias para analizar las estructuras de las comunidades microbianas. La secuenciación Illumina PE250 reveló que las siete etapas de desarrollo de fueron anotadas a 21 filos, 43 clases, 104 órdenes, 188 familias, 391 géneros y 556 especies de bacterias. Entre ellos, 4 filos y 14 géneros estaban presentes en todas las etapas de desarrollo, siendo Proteobacteria el filo dominante y spp. el género dominante. Además, tuvo la mayor abundancia relativa en las siete etapas de desarrollo. Todas las etapas de desarrollo fueron anotadas a una cierta abundancia de spp. La secuenciación Illumina PE150 reveló que las tres muestras (X-I-YDCP: garrapatas adultas de primera generación; X-I-MIX: muestras mixtas de huevos, garrapatas larvales y garrapatas ninfas; X-I-EDCP: garrapatas adultas de segunda generación) de fueron anotadas a seis órdenes, 28 familias, 72 géneros y 158 especies de virus, de los cuales se encontraron 46 géneros y 80 especies en las tres especies de muestras. Hasta donde sabemos, este es el primer estudio que analizó de manera integral la composición de la comunidad microbiana de en diferentes etapas de desarrollo. Basado en los resultados del estudio, se anotaron ciertas abundancias de , virus de la diarrea viral bovina y virus de la fiebre porcina africana a .
Descripción
Las garrapatas son el segundo vector de patógenos más significativo en todo el mundo. es una de las especies de garrapatas dominantes en Mongolia Interior que puede llevar y transmitir varios microorganismos patógenos. Sin embargo, solo se ha detectado un patógeno específico en una etapa de desarrollo particular de , además, el análisis metagenómico se ha realizado solo en la etapa de garrapata adulta. En este estudio, utilizamos en diferentes etapas de desarrollo (garrapatas adultas hembras de primera generación, huevos, garrapatas larvales, garrapatas larvales engordadas, garrapatas ninfas, garrapatas ninfas engordadas y garrapatas adultas de segunda generación) de Mongolia Interior como materiales para la extracción de ácidos nucleicos. Posteriormente, construimos bibliotecas Illumina PE250 e Illumina PE150 y las secuenciamos en la plataforma Illumina NovaSeq 6000. Finalmente, utilizamos software de biología molecular y una plataforma de análisis de secuencias para analizar las estructuras de las comunidades microbianas. La secuenciación Illumina PE250 reveló que las siete etapas de desarrollo de fueron anotadas a 21 filos, 43 clases, 104 órdenes, 188 familias, 391 géneros y 556 especies de bacterias. Entre ellos, 4 filos y 14 géneros estaban presentes en todas las etapas de desarrollo, siendo Proteobacteria el filo dominante y spp. el género dominante. Además, tuvo la mayor abundancia relativa en las siete etapas de desarrollo. Todas las etapas de desarrollo fueron anotadas a una cierta abundancia de spp. La secuenciación Illumina PE150 reveló que las tres muestras (X-I-YDCP: garrapatas adultas de primera generación; X-I-MIX: muestras mixtas de huevos, garrapatas larvales y garrapatas ninfas; X-I-EDCP: garrapatas adultas de segunda generación) de fueron anotadas a seis órdenes, 28 familias, 72 géneros y 158 especies de virus, de los cuales se encontraron 46 géneros y 80 especies en las tres especies de muestras. Hasta donde sabemos, este es el primer estudio que analizó de manera integral la composición de la comunidad microbiana de en diferentes etapas de desarrollo. Basado en los resultados del estudio, se anotaron ciertas abundancias de , virus de la diarrea viral bovina y virus de la fiebre porcina africana a .