El síndrome de domesticación se define como un conjunto de rasgos relacionados con la domesticación que han sufrido cambios genéticos permanentes durante la domesticación de los cereales. Las poblaciones de arroz silvestre australiano no han estado expuestas al flujo genético de las poblaciones de arroz domesticado. Se encontró un alto nivel de variación natural de las secuencias en los loci de domesticación (por ejemplo, la ruptura de semillas, el desarrollo de espigas y el tamaño del grano) en el arroz silvestre australiano del genoma AA del pool genético primario del arroz. Esta variación natural es mucho mayor que la encontrada en el arroz cultivado asiático y en las poblaciones de arroz silvestre asiático. Las poblaciones australianas exhiben un alto nivel de polimorfismos homocigotos en relación con el arroz domesticado, lo que infiere la fijación de alelos silvestres y domesticados distintos. Los alelos de los genes de ruptura de semillas presentes en las poblaciones propensas a la ruptura son probablemente funcionales, mientras que los alelos disfuncionales de estos genes de ruptura de semillas se encuentran en el arroz domesticado. Esto confirma que, a diferencia de las poblaciones de arroz silvestre asiático, las poblaciones de arroz silvestre australiano han permanecido genéticamente aisladas del arroz domesticado, conservando alelos previos a la domesticación en sus poblaciones silvestres que permiten caracterizar de manera única el impacto de la domesticación en el genoma del arroz. Este estudio también proporciona información clave sobre los loci de domesticación en las poblaciones de arroz silvestre australiano que será valiosa en la utilización de estos recursos genéticos en la mejora de cultivos y la domesticación de novo.