La enfermedad de Marek es una enfermedad grave en las gallinas causada por un virus altamente contagioso, que continúa amenazando las granjas avícolas en todo el mundo a pesar de las vacunas existentes. Para entender cómo el virus daña el hígado de las gallinas en las etapas posteriores de la infección, estudiamos gallinas Wenchang infectadas de forma natural utilizando herramientas avanzadas de análisis molecular. Descubrimos 959 genes expresados diferencialmente y 561 metabolitos desregulados en las aves infectadas. Estos cambios revelan cómo el virus subvierte el metabolismo energético hepático, interrumpiendo la forma en que procesan grasas, azúcares y proteínas, e interfiere con funciones celulares vitales como el control del crecimiento y la muerte celular programada. Más notablemente, identificamos interacciones específicas entre enzimas y metabolitos (como la enzima SGPL1 con esfingolípidos) que ayudan al virus a debilitar las defensas de las células mientras promueven el crecimiento tumoral. Al mapear estas correlaciones funcionales entre genes y metabolitos, nuestro estudio descubre cómo el virus modula las vías moleculares del huésped. Estos hallazgos podrían conducir a nuevas estrategias para el control de enfermedades, como tratamientos mejorados, vacunas de precisión y potencialmente diseñar gallinas resistentes a enfermedades, protegiendo en última instancia los medios de vida de los agricultores y salvaguardando la producción avícola.