El análisis de SNP a nivel del genoma revela la estructura poblacional y la diversidad genética en Murr
Autores: Yang, Rong; Wu, Xiuhua; Bai, Yu"e; He, Yujiao; Chang, Sujuan; Hai, Long
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Cultivo medicinal
Cultivo de valor económico
Compuestos bioactivos
Análisis de diversidad genética
Base de datos de SNP de alta densidad
Estructura genética
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
Murr. (goji negro), un cultivo medicinal y económicamente valioso rico en compuestos bioactivos, sigue siendo genómicamente poco estudiado a pesar de su creciente cultivo. Para superar las limitaciones de los marcadores tradicionales en el análisis de diversidad genética y la mejora molecular, empleamos la secuenciación de fragmentos amplificados en loci específicos (SLAF-seq) para desarrollar marcadores SNP a nivel genómico y elucidar la estructura genética de 213 accesiones de poblaciones naturales y cultivadas en Alxa, China. Identificamos 827,630 etiquetas SLAF y 33,121 SNPs de alta calidad distribuidos uniformemente en 12 cromosomas, estableciendo la primera base de datos de SNP de alta densidad para esta especie. Los análisis genéticos de poblaciones revelaron tres clústeres genéticos distintos con
Descripción
Murr. (goji negro), un cultivo medicinal y económicamente valioso rico en compuestos bioactivos, sigue siendo genómicamente poco estudiado a pesar de su creciente cultivo. Para superar las limitaciones de los marcadores tradicionales en el análisis de diversidad genética y la mejora molecular, empleamos la secuenciación de fragmentos amplificados en loci específicos (SLAF-seq) para desarrollar marcadores SNP a nivel genómico y elucidar la estructura genética de 213 accesiones de poblaciones naturales y cultivadas en Alxa, China. Identificamos 827,630 etiquetas SLAF y 33,121 SNPs de alta calidad distribuidos uniformemente en 12 cromosomas, estableciendo la primera base de datos de SNP de alta densidad para esta especie. Los análisis genéticos de poblaciones revelaron tres clústeres genéticos distintos con