Análisis de Diversidad Genética del Virus de los Amarillos de Brassica que Causa Síntomas de Color Aberrante en Colza
Autores: Peng, Qi; Li, Wei; Zhou, Xiaoying; Sun, Chengming; Hou, Yan; Hu, Maolong; Fu, Sanxiong; Zhang, Jiefu; Kundu, Jiban Kumar; Lei, Lei
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Virus amarillo de brassica
Colza
Jiangsu
Patógeno viral
Análisis filogenético
Análisis de recombinación
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 7
Citaciones: Sin citaciones
La aparición del virus amarillo de brassica (BrYV) ha dañado cada vez más los cultivos de crucíferas en China en los últimos años. En 2020, un gran número de colza en Jiangsu mostró un color de hoja aberrante. Un análisis combinado de RNA-seq y RT-PCR identificó a BrYV como el principal patógeno viral. Una encuesta de campo posterior mostró que la incidencia promedio de BrYV fue del 32.04%. Además de BrYV, el virus del mosaico de nabo (TuMV) también se detectó con frecuencia. Como resultado, se clonaron dos aislados de BrYV casi de longitud completa, BrYV-814NJLH y BrYV-NJ13. Basado en las secuencias recién obtenidas y los aislados reportados de BrYV y el virus amarillo de nabo (TuYV), se realizó un análisis filogenético, y se encontró que todos los aislados de BrYV comparten una raíz común con TuYV. El análisis de identidad de aminoácidos por pares reveló que tanto P2 como P3 eran conservados en BrYV. Además, el análisis de recombinación reveló siete eventos recombinantes en BrYV como en TuYV. También intentamos determinar la infección por BrYV mediante un índice cuantitativo de color de hoja, pero no se encontró una correlación significativa entre los dos. Las observaciones sistémicas indicaron que las plantas infectadas por BrYV presentaban diferentes síntomas, como ausencia de síntomas, base del tallo púrpura y hojas viejas rojas. En general, nuestro trabajo demuestra que BrYV está estrechamente relacionado con TuYV y podría considerarse una cepa epidémica para la colza en Jiangsu.
Descripción
La aparición del virus amarillo de brassica (BrYV) ha dañado cada vez más los cultivos de crucíferas en China en los últimos años. En 2020, un gran número de colza en Jiangsu mostró un color de hoja aberrante. Un análisis combinado de RNA-seq y RT-PCR identificó a BrYV como el principal patógeno viral. Una encuesta de campo posterior mostró que la incidencia promedio de BrYV fue del 32.04%. Además de BrYV, el virus del mosaico de nabo (TuMV) también se detectó con frecuencia. Como resultado, se clonaron dos aislados de BrYV casi de longitud completa, BrYV-814NJLH y BrYV-NJ13. Basado en las secuencias recién obtenidas y los aislados reportados de BrYV y el virus amarillo de nabo (TuYV), se realizó un análisis filogenético, y se encontró que todos los aislados de BrYV comparten una raíz común con TuYV. El análisis de identidad de aminoácidos por pares reveló que tanto P2 como P3 eran conservados en BrYV. Además, el análisis de recombinación reveló siete eventos recombinantes en BrYV como en TuYV. También intentamos determinar la infección por BrYV mediante un índice cuantitativo de color de hoja, pero no se encontró una correlación significativa entre los dos. Las observaciones sistémicas indicaron que las plantas infectadas por BrYV presentaban diferentes síntomas, como ausencia de síntomas, base del tallo púrpura y hojas viejas rojas. En general, nuestro trabajo demuestra que BrYV está estrechamente relacionado con TuYV y podría considerarse una cepa epidémica para la colza en Jiangsu.