El licor de prensa de naranja es un subproducto de la producción de jugo de naranja que contiene compuestos bioactivos reconocidos por sus implicaciones beneficiosas en la salud humana. La recuperación de estos compuestos ofrece nuevas oportunidades para la formulación de productos de interés en la industria alimentaria, farmacéutica y cosmética. La clarificación del licor de prensa de naranja mediante procesos de microfiltración (MF) y/o ultrafiltración (UF) es un enfoque válido para eliminar macromoléculas, partículas coloidales y sólidos en suspensión de azúcares y compuestos bioactivos. En este trabajo se estudió la clarificación del licor de prensa de naranja utilizando tres membranas poliméricas de hoja plana: una membrana MF con un tamaño de poro de 0.2 m y dos membranas UF con un corte de peso molecular nominal (MWCO) de 150 y 200 kDa, respectivamente. El rendimiento de la membrana, en términos de flujo de permeado y rechazo de la membrana hacia la hesperidina y los azúcares, se estudió de acuerdo con un enfoque de análisis multivariado. En particular, se analizaron las características que influyen en el rendimiento de las membranas investigadas, como el corte de peso molecular (MWCO), el ángulo de contacto, el grosor de la membrana, la distribución del tamaño de poro, así como las condiciones de operación, incluyendo la temperatura y el tiempo de operación, a través de la regresión de mínimos cuadrados parciales (PLSR). El método multivariado reveló información crucial sobre variables que son relevantes para maximizar el flujo de permeado y minimizar el rechazo de hesperidina y azúcares en la clarificación del licor de prensa de naranja.