Análisis filogenético de poblaciones de ballico (Lolium) y la proliferación de resistencia a ALS en Arabia Saudita
Autores: Ghazy, Abdelhalim I.; Al-Ateeq, Talal K.; Ibrahim, Eid I.; Migdadi, Hussein M.; Attia, Kotb A.; Javed, Muhammad; Khan, Muhammad Altaf; Al-Ashkar, Ibrahim; Al-Doss, Abdullah
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 12
Citaciones: Sin citaciones
Los enfoques morfológicos y de repeticiones simples en secuencia (SSR) se utilizaron para determinar la diversidad genética de 29 genotipos de ballico pertenecientes a ocho poblaciones recolectadas de varias regiones en Arabia Saudita. En este estudio, se examinaron 50 marcadores SSR desarrollados in silico derivados de microsatélites genómicos y de secuencias de etiquetas de expresión (EST). El análisis de varianza mostró diferencias altamente significativas en todos los rasgos estudiados. Se realizó un análisis de conglomerados basado en los datos morfológicos de los 29 genotipos y utilizando el software PAST (estadísticas paleontológicas). Según los resultados, la agrupación se basó principalmente en la ubicación del genotipo. Los genotipos sensibles a herbicidas se agruparon en un grupo. Además, utilizando marcadores EST-SSR, observamos la existencia de un número considerable de variaciones genéticas entre los genotipos. De estos marcadores, solo 31 produjeron productos de amplificación razonables. Los resultados mostraron que 23 marcadores SSR revelaron que el 74.19% eran polimórficos. El número de alelos detectados por cebador varió de uno a cinco en el cebador LTC SSR1. Los cebadores probados amplificaron 1434 bandas en ocho poblaciones, con un promedio de 46.26 bandas por cebador. Los valores de contenido de información de polimorfismo (PIC) variaron de 0.11 a 0.76 para los cebadores LT EST-SSR5 y LTC SSR1. La agrupación del método de grupo de pares no ponderados con promedio aritmético (UPGMA) de los 29 genotipos representando ocho poblaciones se basó esencialmente en sus ubicaciones y niveles de tolerancia a herbicidas. La mayoría de las poblaciones se agruparon en cuatro conglomerados, representando conjuntamente a los genotipos. Además, las poblaciones tolerantes se distinguieron de las sensibles. La relación entre la diversidad genética y la fuente geográfica de las poblaciones de Arabia Saudita se reveló a través de este estudio. Los resultados mostraron que la eficacia de los marcadores SSR desarrollados es transferible entre especies. Han sido útiles para evaluar la diversidad genética de la población de ballico, ya que esto podría aplicarse para diferenciar entre poblaciones tolerantes y sensibles de ballico.
Descripción
Los enfoques morfológicos y de repeticiones simples en secuencia (SSR) se utilizaron para determinar la diversidad genética de 29 genotipos de ballico pertenecientes a ocho poblaciones recolectadas de varias regiones en Arabia Saudita. En este estudio, se examinaron 50 marcadores SSR desarrollados in silico derivados de microsatélites genómicos y de secuencias de etiquetas de expresión (EST). El análisis de varianza mostró diferencias altamente significativas en todos los rasgos estudiados. Se realizó un análisis de conglomerados basado en los datos morfológicos de los 29 genotipos y utilizando el software PAST (estadísticas paleontológicas). Según los resultados, la agrupación se basó principalmente en la ubicación del genotipo. Los genotipos sensibles a herbicidas se agruparon en un grupo. Además, utilizando marcadores EST-SSR, observamos la existencia de un número considerable de variaciones genéticas entre los genotipos. De estos marcadores, solo 31 produjeron productos de amplificación razonables. Los resultados mostraron que 23 marcadores SSR revelaron que el 74.19% eran polimórficos. El número de alelos detectados por cebador varió de uno a cinco en el cebador LTC SSR1. Los cebadores probados amplificaron 1434 bandas en ocho poblaciones, con un promedio de 46.26 bandas por cebador. Los valores de contenido de información de polimorfismo (PIC) variaron de 0.11 a 0.76 para los cebadores LT EST-SSR5 y LTC SSR1. La agrupación del método de grupo de pares no ponderados con promedio aritmético (UPGMA) de los 29 genotipos representando ocho poblaciones se basó esencialmente en sus ubicaciones y niveles de tolerancia a herbicidas. La mayoría de las poblaciones se agruparon en cuatro conglomerados, representando conjuntamente a los genotipos. Además, las poblaciones tolerantes se distinguieron de las sensibles. La relación entre la diversidad genética y la fuente geográfica de las poblaciones de Arabia Saudita se reveló a través de este estudio. Los resultados mostraron que la eficacia de los marcadores SSR desarrollados es transferible entre especies. Han sido útiles para evaluar la diversidad genética de la población de ballico, ya que esto podría aplicarse para diferenciar entre poblaciones tolerantes y sensibles de ballico.