La cría exitosa de variedades de arroz híbrido de alto rendimiento y resistentes a la caída es fundamental para garantizar la seguridad alimentaria. El sistema de arroz híbrido de dos líneas desempeña un papel esencial en la cría de arroz, y 1892S, una línea estéril de dos líneas importante, ha contribuido significativamente al desarrollo de más de 100 variedades de arroz híbrido con características agronómicas superiores, incluida la resistencia a la caída. A pesar de su importancia, ha faltado una comprensión completa de la base genómica subyacente a estas características en 1892S debido a las limitaciones de las tecnologías de secuenciación de lecturas cortas. Para abordar esta brecha, utilizamos técnicas avanzadas de ensamblaje de genomas de telómero a telómero (T2T) para generar un genoma de alta calidad y sin brechas de 1892S; el genoma final comprende 12 cromosomas completos con 40,560 genes que codifican proteínas. El análisis genómico comparativo identificó múltiples genes conocidos de resistencia a la caída, con variaciones alélicas únicas que pueden mejorar la resistencia. El análisis del pan-genoma identificó 2347 genes específicos de cepa en 1892S, lo que respalda aún más sus ventajas genéticas únicas. Este estudio representa el ensamblaje completo del genoma T2T de una línea estéril de dos líneas y proporciona nuevas perspectivas sobre la base genética de la resistencia a la caída en el arroz híbrido. Este estudio destaca el potencial genético de 1892S en la cría de arroz híbrido y proporciona un modelo para el análisis genómico de otras líneas estériles de dos líneas, ofreciendo valiosas perspectivas para mejorar el arroz híbrido, incluidas las características de resistencia a la caída, estabilidad de rendimiento y adaptabilidad, que son cruciales para la seguridad alimentaria global.