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Análisis del genoma completo de genes: identificación, evolución, genómica comparativa, dinámica de expresión y localización subcelular en

Autores: He, Xiaoli; Zheng, Ruiyi; Chen, Yan; Tan, Chengfang

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2025

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Acceso abierto

Artículo científico


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Botánica

Palabras clave

Genes
Determinación del destino celular
Especificación del plan corporal
Embriogénesis
Modelos de poliploidia
Triplicación del genoma

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 7

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Los genes desempeñan roles cruciales en la determinación del destino celular y la especificación del plan corporal durante la embriogénesis temprana. Sin embargo, la estructura genética específica y la diferenciación funcional de en aún no están claras. Investigamos genes en (), (), y (), que son modelos de poliploidia con duplicación del genoma después de la divergencia -. En total, se identificaron 15, 14 y 32 genes en , , y , respectivamente. El análisis filogenético clasificó () en tres clases con organización de dominio conservada. El análisis de sinonimia indicó que la expansión de la familia durante la alopoliploidización se debió principalmente a duplicaciones de genes completos y segmentales. Los análisis de elementos -, estructura genética y patrones de expresión mostraron una alta conservación dentro del mismo grupo. Los resultados de RNA-seq y qRT-PCR se dividieron en tres clases con patrones de expresión distintos: la Clase I mostró una expresión moderada y específica en yemas y puntas de inflorescencias; la Clase III mostró una expresión baja específica en semillas y estambres; mientras que la segunda clase mostró expresión en la mayoría de los tejidos. Los resultados de localización subcelular mostraron que los tres genes candidatos de las tres clases exhibieron localizaciones subcelulares distintas, con BnSTM-C y BnKNAT3a-A predominantemente en el núcleo y BnKNATM1-A en el citoplasma, lo que indica diferentes patrones de expresión. En conjunto, estos hallazgos proporcionan una base para futuros estudios funcionales de genes en .

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