Análisis Integrado de microARNs y Objetivos de Factores de Transcripción en la Transición Floral de
Autores: Yao, Wenjing; Shen, Peng; Yang, Meng; Meng, Qianyu; Zhou, Rui; Li, Long; Lin, Shuyan
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Análisis Integrado de microARNs y Objetivos de Factores de Transcripción en la Transición Floral deCategoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Bambú
Floración
MiARN
Expresión génica
Transición floral
Factores de transcripción
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
Las plantas de bambú tienen hábitos de floración erráticos con un largo crecimiento vegetativo y un ciclo de floración incierto. El proceso de transición floral siempre ha sido uno de los temas candentes e intrigantes en la biología del desarrollo del bambú. Como moduladores maestros de la expresión génica a nivel post-transcripcional, los miARNs juegan un papel crucial en la regulación del crecimiento reproductivo, especialmente en la transición floral de las plantas con flores. es una especie de bambú ornamental de excelente cobertura del suelo. En este estudio, realizamos un perfil de expresión de miARN en los brotes de tallo y los brotes florales de la especie de bambú, para investigar los miARNs relacionados con la floración en las plantas de bambú. Se identificaron un total de 179 miARNs maduros de , incluyendo 120 miARNs conocidos y 59 miARNs nuevos, de los cuales 96 (61 miARNs conocidos y 35 miARNs nuevos) se expresaron diferencialmente en los brotes en diferentes etapas de crecimiento. Basado en la predicción de genes objetivo (TG), se anotaron un total de 2099 factores de transcripción (TFs) como TGs de los 96 miARNs expresados diferencialmente (DEMs), correspondientes a 839 registros de pares DEM-TF. Además, identificamos 23 DEMs conocidos involucrados en la floración y seis miARNs conocidos relacionados con el desarrollo de órganos florales según informes previos. Entre estos, había 11 miARNs expresados diferencialmente significativos, con 124 objetivos de TF correspondientes a 132 pares DEM-TF en . En particular, nos centramos en la identificación de módulos -SPL (proteína similar a la unión del promotor SQUAMOSA) en la vía de la edad, que son bien conocidos por regular la transición de la fase vegetativa a la reproductiva en las plantas con flores. Se identificaron un total de 36 objetivos de TF de , entre los cuales había 11 SPLs. El ensayo de expresión transitoria de Dual-Luciferase indicó que mediaba la represión de los objetivos PpSPL en . El análisis integrado de miARNs y TGs a escala genómica en este estudio proporciona información sobre los roles esenciales de los miARNs individuales en la modulación de la transición floral a través de la regulación de los objetivos de TF en las plantas de bambú.
Descripción
Las plantas de bambú tienen hábitos de floración erráticos con un largo crecimiento vegetativo y un ciclo de floración incierto. El proceso de transición floral siempre ha sido uno de los temas candentes e intrigantes en la biología del desarrollo del bambú. Como moduladores maestros de la expresión génica a nivel post-transcripcional, los miARNs juegan un papel crucial en la regulación del crecimiento reproductivo, especialmente en la transición floral de las plantas con flores. es una especie de bambú ornamental de excelente cobertura del suelo. En este estudio, realizamos un perfil de expresión de miARN en los brotes de tallo y los brotes florales de la especie de bambú, para investigar los miARNs relacionados con la floración en las plantas de bambú. Se identificaron un total de 179 miARNs maduros de , incluyendo 120 miARNs conocidos y 59 miARNs nuevos, de los cuales 96 (61 miARNs conocidos y 35 miARNs nuevos) se expresaron diferencialmente en los brotes en diferentes etapas de crecimiento. Basado en la predicción de genes objetivo (TG), se anotaron un total de 2099 factores de transcripción (TFs) como TGs de los 96 miARNs expresados diferencialmente (DEMs), correspondientes a 839 registros de pares DEM-TF. Además, identificamos 23 DEMs conocidos involucrados en la floración y seis miARNs conocidos relacionados con el desarrollo de órganos florales según informes previos. Entre estos, había 11 miARNs expresados diferencialmente significativos, con 124 objetivos de TF correspondientes a 132 pares DEM-TF en . En particular, nos centramos en la identificación de módulos -SPL (proteína similar a la unión del promotor SQUAMOSA) en la vía de la edad, que son bien conocidos por regular la transición de la fase vegetativa a la reproductiva en las plantas con flores. Se identificaron un total de 36 objetivos de TF de , entre los cuales había 11 SPLs. El ensayo de expresión transitoria de Dual-Luciferase indicó que mediaba la represión de los objetivos PpSPL en . El análisis integrado de miARNs y TGs a escala genómica en este estudio proporciona información sobre los roles esenciales de los miARNs individuales en la modulación de la transición floral a través de la regulación de los objetivos de TF en las plantas de bambú.