Atherinella blackburni es una especie de pejerrey cuya presencia en la costa brasileña no se registró adecuadamente hasta hace poco. Hasta ahora, los registros de su distribución a lo largo de la costa brasileña se limitaban a la isla de Itaparica, estado de Bahía, y Porto Inhaúma, estado de Río de Janeiro. En un estudio reciente de la ictiofauna de la playa de Itamambuca, Ubatuba, estado de São Paulo, se recolectaron 100 especímenes de esta especie, lo que proporcionó una fuente considerable de información sobre su ecología y estableció un nuevo límite sur para su distribución. Un estudio detallado de una colección ictiológica reveló la presencia de gran cantidad de esta especie en regiones del noreste brasileño, lo que resultó en una expansión hacia el norte de la presencia de A. blackburni en aguas brasileñas. Además de las poblaciones que se encuentran en la costa brasileña, la especie también se encuentra de forma discontinua en las costas atlánticas de Costa Rica, Panamá y Venezuela. El análisis merístico y morfométrico mostró valores superpuestos entre las poblaciones brasileñas y las más cercanas al Caribe. Un estudio ecológico de A. blackburni en la playa de Itamambuca reveló que se trata de una especie predominantemente diurna con preferencia por aguas cálidas y saladas, que a menudo se encuentra en ambientes con fondos arenosos. Fue más abundante en verano e invierno, cuando también se encontraron individuos con valores menores de longitud y peso.