El cinetoplasto es una región especializada de la mitocondria de los tripanosomátidos que alberga el ADN mitocondrial más complejo e inusual encontrado en la naturaleza. El ADN cinetoplástico (kDNA) está compuesto por miles de moléculas circulares interconectadas topológicamente para formar una sola red. Dos tipos de círculos de ADN están presentes en el cinetoplasto: minicírculos (0.5-10 kb) y maxicírculos (20-40 kb). El conocimiento de la arquitectura del cinetoplasto es crucial para entender la replicación y segregación de los círculos de kDNA, ya que las moléculas involucradas en estos procesos están precisamente posicionadas en dominios funcionales a lo largo del cinetoplasto. La estructura fina del cinetoplasto fue revelada en estudios tempranos de microscopía electrónica (ME). Sin embargo, la comprensión de la organización topológica del kDNA solo se demostró después del desarrollo de protocolos