La Laguna de Bacalar (BL) en Quintana Roo, México; es un área de alto interés debido a su potencial turístico. Sin embargo, los cambios en los patrones de uso de suelo, urbanización, ganadería extensiva y agricultura en rápida expansión, han generado impactos negativos en áreas de comunidades planas adyacentes y hábitats de vida silvestre. El objetivo de este estudio es evaluar el nivel de conservación de la vegetación en la porción sur de la BL a través de la avifauna presente en sitios con grados contrastantes de conservación. Además, cambiar «y su(s) preferencia(s) de hábitat en las diferentes comunidades» por y sus preferencias de uso del hábitat en las diferentes comunidades. Para evaluar el grado de conservación de la BL, se realizaron visitas de campo y recolecciones botánicas para identificar las especies. Para el conteo e identificación de aves, se realizaron censos mensuales a través de recorridos costeros a lo largo del cenote Xul-ha en transectos de 2.5 km. Se establecieron cuatro transectos: dos para sitios caracterizados como semiconservados y dos con sitios perturbados. Se observó una riqueza total de 40 taxa, que corresponde al 8.1% de la avifauna de Quintana Roo y 32% a aves de humedal (125 especies). Las curvas de acumulación de especies indicaron que los sitios semiconservados y perturbados tienden a alcanzar asíntotas y con un porcentaje de cobertura mayor al 90%. En cuanto a la diversidad y la estructura de la comunidad, no se observaron diferencias significativas. Sin embargo, los sitios semiconservados y perturbados tienen cada uno 11 especies únicas y comparten 18 especies. El LB tiene una diversidad intermedia de especies de aves en comparación con estudios a nivel mexicano, el hábitat es importante para la conservación de la avifauna; ya que funciona como reservorio de diversidad. Se han sugerido estrategias que promuevan el turismo sustentable, apoyen la restauración de la vegetación natural; y faciliten el desarrollo económico de la región.