El azufre es un elemento crítico en los ecosistemas naturales, desempeñando un papel central en la transferencia de energía y el ciclo de nutrientes. A pesar de su importancia, la forma en que los microbios impulsan las transformaciones del azufre en entornos únicos como la piscina de azufre de Isinuka, conocida por sus propiedades curativas, no se comprende bien. Este estudio tuvo como objetivo explorar las comunidades microbianas en el agua y los sedimentos de esta piscina rica en azufre, centrándose en su diversidad, roles e impacto en el ciclo del azufre y los nutrientes. Al utilizar tecnologías avanzadas de secuenciación de ADN, descubrimos poblaciones microbianas distintas en el agua y los sedimentos. La columna de agua anóxica y expuesta a la luz fomentó un ciclo de azufre, carbono y nitrógeno estrechamente acoplado, impulsado por consorcios microbianos especializados adaptados a fotótrofos anaerobios, mientras que los sedimentos albergaron microbios reductores de sulfato de la familia Desulfobacteraceae, adaptados a entornos de bajo oxígeno. Estas bacterias trabajan juntas para mantener el ciclo del azufre, que es crítico para sostener la vida en el ecosistema. Notablemente, se detectó una alta abundancia de Coxiellaceae no clasificados en los sedimentos, que pueden estar vinculados a la contaminación humana debido al uso de la piscina para balneoterapia. El estudio también reveló que estos microbios contribuyen a procesos más amplios como el ciclo del nitrógeno y del carbono, impactando la regulación de gases de efecto invernadero. Comprender estos mecanismos no solo mejora el conocimiento científico, sino que también podría informar estrategias de gestión ambiental y el desarrollo de tecnologías sostenibles. Esta investigación destaca la importancia de preservar ecosistemas únicos como Isinuka por su valor ecológico y sus posibles beneficios sociales.