Los bioinoculantes a base de cianobacterias representan una solución sostenible para mejorar la fertilidad del suelo y la productividad de los cultivos. Esta investigación evaluó el potencial biofertilizante de dos cepas indígenas de cianobacterias fijadoras de nitrógeno (Har. y Lemmerm.) en el crecimiento y rendimiento del tomate. Se llevó a cabo un experimento en invernadero para estudiar sus efectos en las propiedades del suelo, el crecimiento y la fisiología de las plantas, y el rendimiento/calidad de los frutos. Las cepas se aplicaron individualmente, como un consorcio, o combinadas con fertilizantes orgánicos o minerales a la mitad de la dosis estándar (50%). Todos los bioinoculantes mejoraron la fertilidad del suelo, el crecimiento de las plantas y el rendimiento/calidad de los frutos en comparación con el control. La mejora más significativa se observó en el consorcio enmendado con el 50% de fertilizante convencional (compost o NPK), en comparación con las cepas individuales. El análisis de correlación reveló fuertes asociaciones positivas entre los pigmentos fotosintéticos, la productividad de las plantas y los rasgos bioquímicos de los frutos, indicando respuestas fisiológicas coordinadas bajo los tratamientos aplicados. Los resultados demostraron que el consorcio de cianobacterias terrestres diazotróficas posee propiedades biofertilizantes para el tomate que pueden ser utilizadas de manera eficiente en la producción de cultivos. Estos hallazgos sugieren que tales formulaciones ofrecen un enfoque rentable para el cultivo de tomates y presentan una alternativa sostenible para la gestión integrada y optimizada de fertilizantes.