Los flavonoides son una clase de metabolitos secundarios sintetizados por las plantas, caracterizados por un esqueleto de carbono C6-C3-C6 y derivados de la vía de metabolismo del fenilpropano. Desempeñan roles biológicos cruciales, no solo en la producción de pigmentos vegetales y en las respuestas a estrés biótico y abiótico, sino también en aplicaciones medicinales. En consecuencia, la biosíntesis y los mecanismos regulatorios de los flavonoides han sido un punto focal en la investigación sobre la transcripción y la expresión génica en plantas. Las vías biosintéticas de los flavonoides incluyen ramas como isoflavonas, flavonas, flavonoles, antocianinas y proantocianidinas, con algunas vías y enzimas clave ya bien caracterizadas. Los estudios indican que los flavonoides vegetales son regulados por diversos factores, incluidos factores de transcripción, pequeños ARN endógenos no codificantes (miARN) y hormonas vegetales. Esta revisión resume sistemáticamente la estructura y clasificación de los flavonoides vegetales, sus mecanismos biosintéticos y regulatorios, y los factores que influyen en la síntesis de flavonoides. Al discutir la regulación de la expresión génica relacionada con los flavonoides en plantas, este trabajo proporciona valiosos conocimientos y una base teórica para futuras investigaciones y aplicaciones de flavonoides.