Capture-SELEX: Selección de aptámeros de ADN para antibióticos aminoglucósidos

Las moléculas orgánicas pequeñas son objetivos difíciles para la selección de aptámeros mediante la tecnología SELEX (SELEX-Systematic Evolution of Ligans by EXponential enrichment). A menudo no son adecuadas para la inmovilización en superficies sólidas, que es un procedimiento común en los métodos conocidos de selección de aptámeros. El procedimiento Capture-SELEX permite la selección de aptámeros de ADN para dianas de solutos. Se construyó una biblioteca SELEX especial con el objetivo de inmovilizar esta biblioteca en perlas magnéticas u otras superficies. Para ello, se incorporó una secuencia de acoplamiento en la región aleatoria de la biblioteca que permite la hibridación con un oligo complementario fijado en perlas magnéticas. Los oligonucleótidos de la biblioteca que muestran una alta afinidad con la diana y una estructura secundaria que se ajusta a la diana se liberan de las microesferas para unirse a la diana durante el proceso de selección del aptámero. Los oligonucleótidos de estos complejos de unión se amplificaron, purificaron e inmovilizaron mediante la secuencia de acoplamiento a las perlas magnéticas como punto de partida de la siguiente ronda de selección. Basándose en este procedimiento Capture-SELEX, se describe la exitosa selección de aptámeros de ADN para el antibiótico aminoglucósido kanamicina A como diana de moléculas pequeñas.

Autores: Regina, Stoltenburg; Nadia, Nikolaus; Beate, Strehlitz