La dinámica de las macrófitas acuáticas en ríos intermitentes generalmente se relaciona con las características de resistencia y resiliencia de las plantas a las perturbaciones hidrológicas de inundaciones y sequías. En la región semiárida de Brasil, los ríos y arroyos intermitentes se ven afectados por perturbaciones con intensidad, frecuencia y duración variables a lo largo de sus ciclos hidrológicos. El objetivo del presente estudio es determinar la presencia y variación de la biomasa de especies de macrófitas acuáticas en dos ríos intermitentes con distintos regímenes hidrológicos. Se determinó su dinámica con respecto a las respuestas de resistencia y resiliencia de las macrófitas a eventos de inundaciones y sequías mediante la estimación de la variación de la biomasa y la productividad a lo largo de dos ciclos hidrológicos. Se realizaron veintiún visitas durante las fases de rehumidificación, desecación y sequía en un charco permanente en el arroyo Avelós y dos charcos temporales en el río Taperoá, estado de Paraíba, noreste de Brasil. El muestreo se realizó mediante el método cuadrático. Durante el presente estudio, se produjeron inundaciones de diferentes magnitudes en el río y el arroyo. Los resultados mostraron que las inundaciones y las sequías son factores determinantes en la presencia de macrófitos y en la estructura de sus comunidades acuáticas. La riqueza de especies de las comunidades de macrófitos acuáticos fue menor en las pozas del río y el arroyo sujetas a inundaciones, en comparación con las zonas donde se retiene el agua de escorrentía. Al inicio del proceso de recolonización, la intensidad de las inundaciones fue decisiva en la productividad y biomasa de los macrófitos acuáticos en el río Taperoá y el arroyo Avelós. En niveles intermedios de perturbación, se registraron los mayores valores de productividad y biomasa, y el menor tiempo para el inicio del proceso de recolonización.