Clonación de genes e identificación de genes responsivos a inundaciones en (L.) Rich
Autores: Zhang, Rui; Xuan, Lei; Ni, Longjie; Yang, Ying; Zhang, Ya; Wang, Zhiquan; Yin, Yunlong; Hua, Jianfeng
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Tolerancia a inundaciones
Alcohol deshidrogenasa
Familia de genes
Localización subcelular
Expresión génica
Fermentación de etanol
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 5
Citaciones: Sin citaciones
Como especie de árbol tolerante a inundaciones, se ha utilizado en proyectos de reforestación y ha demostrado tener un valor importante en áreas inundadas. La alcohol deshidrogenasa (ADH), que participa en la fermentación del etanol, es esencial para la tolerancia a las condiciones anaeróbicas causadas por las inundaciones. En un análisis exhaustivo de la familia de genes, se clonaron genes sobre la base de la secuenciación del genoma completo, y luego se realizaron análisis bioinformáticos, localización subcelular y análisis del nivel de expresión génica bajo inundación. Los resultados muestran que las secuencias de proteínas putativas de 15 genes clonados contenían siete y ocho genes (uno incluido) que se dividieron en cinco clados. Todas las secuencias tenían un dominio ADH_N, y excepto uno, todos los demás genes tenían un dominio ADH_zinc_N. Además, los TdADHs en los clados A, B, C y D tenían una composición de motivos similar. Adicionalmente, el número de aminoácidos de TdADH oscilaba entre 277 y 403, con un promedio de 370.13. La localización subcelular mostró que, excepto uno que no se expresó en el núcleo, los otros genes se expresaron predominantemente tanto en el núcleo como en el citosol. Uno de los genes se reguló significativamente al alza en los tres órganos (raíces, tallos y hojas), y también se reguló altamente al alza bajo un tratamiento de inundación de 24 horas; los dos genes podrían desempeñar roles clave en la fermentación del etanol y la tolerancia a inundaciones. Estos hallazgos ofrecen una comprensión integral y podrían proporcionar una base para la cría molecular y la investigación actual sobre los mecanismos moleculares que impulsan la tolerancia a inundaciones.
Descripción
Como especie de árbol tolerante a inundaciones, se ha utilizado en proyectos de reforestación y ha demostrado tener un valor importante en áreas inundadas. La alcohol deshidrogenasa (ADH), que participa en la fermentación del etanol, es esencial para la tolerancia a las condiciones anaeróbicas causadas por las inundaciones. En un análisis exhaustivo de la familia de genes, se clonaron genes sobre la base de la secuenciación del genoma completo, y luego se realizaron análisis bioinformáticos, localización subcelular y análisis del nivel de expresión génica bajo inundación. Los resultados muestran que las secuencias de proteínas putativas de 15 genes clonados contenían siete y ocho genes (uno incluido) que se dividieron en cinco clados. Todas las secuencias tenían un dominio ADH_N, y excepto uno, todos los demás genes tenían un dominio ADH_zinc_N. Además, los TdADHs en los clados A, B, C y D tenían una composición de motivos similar. Adicionalmente, el número de aminoácidos de TdADH oscilaba entre 277 y 403, con un promedio de 370.13. La localización subcelular mostró que, excepto uno que no se expresó en el núcleo, los otros genes se expresaron predominantemente tanto en el núcleo como en el citosol. Uno de los genes se reguló significativamente al alza en los tres órganos (raíces, tallos y hojas), y también se reguló altamente al alza bajo un tratamiento de inundación de 24 horas; los dos genes podrían desempeñar roles clave en la fermentación del etanol y la tolerancia a inundaciones. Estos hallazgos ofrecen una comprensión integral y podrían proporcionar una base para la cría molecular y la investigación actual sobre los mecanismos moleculares que impulsan la tolerancia a inundaciones.