El aceite de sacha inchi fue co-microencapsulado con extractos antioxidantes naturales (NAE), como el fruto de camu-camu (Myrciaria dubia (HBK) Mc Vaugh), la variedad de papa andina Añil (Solanum phureja), y el fruto de saúco (Sambucus). La goma arábiga y la combinación ternaria de goma arábiga (GA) + maltodextrina (MD) + aislado de proteína de suero (WPI) en diferentes formulaciones se utilizaron como materiales de recubrimiento para el proceso de encapsulación mediante secado por pulverización. Se evaluaron el contenido de humedad, la distribución del tamaño de partícula y morfología, el contenido fenólico total, la actividad antioxidante, la composición de ácidos grasos y esteroles, la estabilidad oxidativa y la vida útil. Las co-microcápsulas de aceite de sacha inchi con extracto de piel de camu camu (CCSE) a 200 ppm encapsuladas con GA + MD + WPI tuvieron el mayor contenido total de polifenoles (4239.80 ug GAE/g de polvo), actividad antioxidante (12,454.00 ug trolox/g de polvo), contenido de omega-3 (56.03%), beta-sitosterol (62.5%), mayor estabilidad oxidativa (temperatura de inicio de oxidación de 189 grados Celsius), mayor vida útil (3116 h) y tamaños de partículas más pequeños (6.42 m). Esta investigación mejora el conocimiento para obtener microcápsulas que contienen aceite de sacha inchi con extractos antioxidantes naturales que podrían utilizarse para el desarrollo de alimentos funcionales. Se necesita más investigación para estudiar las posibles interacciones y su influencia entre los componentes bioactivos de las microcápsulas y los desafíos que pueden surgir durante la escalada a la producción industrial.