Introducción. El contenido de impurezas en las sustancias activas y formas farmacéuticas es un tópico de suma importancia ya que un alto contenido de subproductos podría poner en riesgo a la población. En función del conocimiento de la estructura se tienen diferentes límites. Por lo tanto, es mandatorio conocer el origen y las estructuras químicas de las impurezas con objeto de poder limitarlas. En lo que respecta a los procesos de fabricación, siempre hay una pequeña posibilidad de que algún proceso tenga una excursión en alguna variable ya sea por error humano o por falla en algún equipo. Intención. Por lo tanto, es necesario saber cómo gestionar este tipo de problemáticas y lo más importante evitar reincidencias. Para lograr este objetivo es necesario desarrollar una metodología que brinde una pauta seguir. El conocimiento de la estructura, así como una investigación de carácter científico ayudara a proponer las medidas correctivas operativas adecuadas para evitar la recurrencia y poder continuar la fabricación de producto que cumpla con las normativas y especificaciones vigentes. La implementación de acciones que deriven en el rápido control de las problemáticas es de capital importancia para la industria farmacéutica con el objetivo tener medidas alternativas de control y seguir fabricando ya que los pacientes esperan esas medicinas. Resultados. En esta revisión se presenta una metodología para elucidar impurezas orgánicas ya sea en las sustancias activas o en las formas farmacéuticas. Se presentarán diez casos teóricos y se ejemplificara con casos similares descritos en la literatura. También se comentarán las principales herramientas utilizadas para realizar investigaciones. Así mismo, se brindará una perspectiva de los avances analíticos utilizados para elucidar impurezas. Finalmente, se comentarán algunas propuestas de control.