Estudiamos la microbiota intestinal de los cerdos Ningxiang, una raza de ganado chino protegida, centrándonos en cuatro sitios clave de absorción de nutrientes (gástrico, íleon, ciego y colon). Utilizando secuenciación de 16S rRNA y análisis bioinformáticos, encontramos diferencias significativas en la diversidad microbiana (diversidad alfa y beta) entre estos tejidos. La microbiota estaba dominada por ciertos grupos, siendo prominentes en regiones específicas. El análisis LEfSe identificó comunidades microbianas específicas de tejido, como f_ en el ciego y o_ en el estómago. El perfil funcional reveló roles en la digestión, el metabolismo y los procesos celulares. Estos resultados destacan la importancia de la microbiota específica de tejido en la absorción de nutrientes y la salud, ofreciendo perspectivas para futuros estudios nutricionales.