Análisis comparativo a nivel genómico de dos cultivares: Perspectivas sobre la biosíntesis de terpenoides volátiles
Autores: Ritz, Manfred; Ahmad, Nadim; Brueck, Thomas; Mehlmer, Norbert
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Planta ornamental
Terpenos
Compuestos similares a terpenos
Cultivares
Nivel genómico
Terpeno sintasa
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 7
Citaciones: Sin citaciones
también conocido como barba azul, es una planta ornamental que contiene una gran variedad de terpenos y compuestos similares a terpenos. Cuatro cultivares diferentes fueron sometidos a un análisis de componentes principales para elucidar las variaciones en la biosíntesis de terpenoides y, en consecuencia, dos cultivares representativos fueron secuenciados a nivel genómico. La anotación funcional de genes, así como el análisis comparativo del genoma en conjuntos de datos de lecturas largas, permitió la identificación de secuencias de sintasas de terpenos y enzimas citocromo p450 específicas de cultivares. Esto permite nuevos conocimientos, especialmente dado que los terpenoides en la investigación y la industria están ganando un interés creciente debido a su importancia en áreas como la conservación de alimentos, fragancias o como ingredientes activos en formulaciones farmacéuticas. Según las evaluaciones de BUSCO, los genomas presentados tienen un tamaño promedio de 355 Mb y aproximadamente un 96.8% de completitud. Se pudo anotar un promedio de 52,090 genes como proteínas putativas, mientras que aproximadamente 42 estaban asociadas con sintasas de terpenos y alrededor de 1340 con enzimas citocromo p450.
Descripción
también conocido como barba azul, es una planta ornamental que contiene una gran variedad de terpenos y compuestos similares a terpenos. Cuatro cultivares diferentes fueron sometidos a un análisis de componentes principales para elucidar las variaciones en la biosíntesis de terpenoides y, en consecuencia, dos cultivares representativos fueron secuenciados a nivel genómico. La anotación funcional de genes, así como el análisis comparativo del genoma en conjuntos de datos de lecturas largas, permitió la identificación de secuencias de sintasas de terpenos y enzimas citocromo p450 específicas de cultivares. Esto permite nuevos conocimientos, especialmente dado que los terpenoides en la investigación y la industria están ganando un interés creciente debido a su importancia en áreas como la conservación de alimentos, fragancias o como ingredientes activos en formulaciones farmacéuticas. Según las evaluaciones de BUSCO, los genomas presentados tienen un tamaño promedio de 355 Mb y aproximadamente un 96.8% de completitud. Se pudo anotar un promedio de 52,090 genes como proteínas putativas, mientras que aproximadamente 42 estaban asociadas con sintasas de terpenos y alrededor de 1340 con enzimas citocromo p450.