Los fitochelatinas (PCs) son pequeños péptidos ricos en cisteína involucrados en la detoxificación de metales, no codificados genéticamente, sino sintetizados enzimáticamente por las fitochelatina sintasas (PCSs) a partir de glutatión. La expresión constitutiva de PCS incluso en ausencia de contaminación por metales, la amplia distribución filogenética y la similitud entre las PCSs y el dominio catalítico de la proteasa de cisteína tipo papaína sugieren una amplia gama de funciones para las PCSs. Estas proteínas, ampliamente estudiadas en plantas terrestres, no han sido completamente analizadas en algas y cianobacterias, aunque estos organismos son los primeros en enfrentar el estrés por metales pesados en ambientes acuáticos y pueden ser explotados para la fitorremediación. Para llenar este vacío, comparamos las características de las proteínas PCS de diferentes taxones de cianobacterias y algas mediante un enlace filogenético. Las secuencias analizadas caen en dos grupos principales de proteínas similares a PCS, ya conocidos. Contrario a suposiciones previas, no se clasifican como secuencias procariotas y eucariotas, sino más bien como secuencias caracterizadas por la presencia alternativa de residuos de asparagina y ácido aspártico/glutámico en proximidad de la cisteína catalítica. La presencia de estas enzimas con características peculiares sugiere diferencias en su regulación post-traduccional relacionadas con los requisitos celulares/ambientales o diferentes funciones celulares en lugar de diferencias debidas a su pertenencia a diferentes taxones filogenéticos.